291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5106 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  100 
 
 
349 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  82.49 
 
 
342 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  74.03 
 
 
398 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  74.42 
 
 
357 aa  482  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  69.97 
 
 
350 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0674  adenosine deaminase  64.81 
 
 
343 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0226748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  61.88 
 
 
384 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  60.24 
 
 
349 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  61.47 
 
 
342 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3173  adenosine deaminase  60.47 
 
 
378 aa  360  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  58.02 
 
 
358 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0605  adenosine deaminase  57.99 
 
 
340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.624245  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24030  adenosine deaminase  55.49 
 
 
343 aa  342  7e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0572  adenosine deaminase  56.08 
 
 
355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00357349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4085  adenosine deaminase  47.89 
 
 
330 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  47.01 
 
 
325 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  45.97 
 
 
328 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  44.48 
 
 
333 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  32.96 
 
 
354 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  36.58 
 
 
342 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  36.81 
 
 
324 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3645  adenosine deaminase  37.06 
 
 
336 aa  165  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  34.47 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  34.98 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  35.49 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  34.16 
 
 
332 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  33.54 
 
 
353 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  36.69 
 
 
327 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  28.02 
 
 
326 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  27.49 
 
 
326 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  32.67 
 
 
346 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  34.41 
 
 
348 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  33.96 
 
 
366 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  32.52 
 
 
331 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  35.39 
 
 
327 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  34.72 
 
 
360 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  35.39 
 
 
327 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  32.13 
 
 
341 aa  149  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  31.96 
 
 
346 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  33.64 
 
 
337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  34.25 
 
 
325 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  32.85 
 
 
346 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  31.8 
 
 
331 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  32.21 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  31.18 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  34.88 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  33.81 
 
 
341 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  33.81 
 
 
341 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  33.81 
 
 
341 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  33.81 
 
 
341 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  31.34 
 
 
335 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  33.04 
 
 
350 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  33.43 
 
 
350 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  30.84 
 
 
347 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  35.69 
 
 
336 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  33.53 
 
 
340 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  30.84 
 
 
347 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  30.18 
 
 
331 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  29.7 
 
 
376 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  31.4 
 
 
331 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  34.57 
 
 
378 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  34.25 
 
 
322 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  30.7 
 
 
336 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  32.76 
 
 
341 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  32.76 
 
 
341 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  32.76 
 
 
341 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  31.21 
 
 
331 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  34.21 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  32.46 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  33.71 
 
 
359 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  31.88 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  32.29 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  32.76 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  33.84 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  30.79 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  31.88 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  33.04 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  32.83 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  31.36 
 
 
354 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  31.69 
 
 
341 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  36.92 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  29.09 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  32.52 
 
 
332 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  29.39 
 
 
376 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  30.49 
 
 
331 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  36.45 
 
 
332 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  32.29 
 
 
341 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  35.92 
 
 
366 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  33.14 
 
 
345 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  31.61 
 
 
341 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  33.01 
 
 
315 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  31.71 
 
 
682 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  31.71 
 
 
682 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  30.49 
 
 
331 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  30.49 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  30.77 
 
 
351 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  36.21 
 
 
334 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  29.79 
 
 
338 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  30.18 
 
 
331 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  32.85 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>