285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0041 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  100 
 
 		 332 aa  683    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  87.92 
 
 		 331 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  81.57 
 
 		 331 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  81.87 
 
 		 331 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  81.21 
 
 		 331 aa  568  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  81.57 
 
 		 331 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  81.27 
 
 		 331 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  80 
 
 		 331 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  80.3 
 
 		 331 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  80 
 
 		 331 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  80.3 
 
 		 331 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  81.87 
 
 		 331 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  79.22 
 
 		 332 aa  541  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  63.98 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  63.83 
 
 		 334 aa  434  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  62.92 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  61.09 
 
 		 332 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  59.51 
 
 		 333 aa  418  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  60.12 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  60.12 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  60.12 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  60.43 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  60.12 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  59.57 
 
 		 334 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  60.12 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  60.12 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  59.82 
 
 		 333 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  59.57 
 
 		 334 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  60.12 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  59.52 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  59.82 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  59.52 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  59.82 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  59.82 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  59.82 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  59.88 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  59.52 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  57.75 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  58.15 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  54.91 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  36.11 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  35.78 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  35.47 
 
 		 376 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  35.47 
 
 		 376 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  36.02 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  35.19 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  34.66 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  33.13 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  34.16 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  31.27 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  32.62 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  32.41 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  34.44 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  30.4 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  29.6 
 
 		 326 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  31.66 
 
 		 342 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  28.66 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  29.32 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  30.96 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  28.62 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  30.65 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  29.94 
 
 		 340 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  34.12 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  29.32 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  32.08 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2936  adenosine deaminase  32.51 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000510583  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  32.43 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1002  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 367 aa  159  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  32.63 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  31.79 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  33.98 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  31.16 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  30.95 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  30.28 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  31.48 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  29.81 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  31.12 
 
 		 367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  31.25 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  32.52 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  27.24 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1027  adenosine deaminase  30.81 
 
 		 371 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  30.15 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  29.7 
 
 		 360 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0321  adenosine deaminase  30.7 
 
 		 344 aa  149  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.949208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  29.41 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  33.55 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  32.16 
 
 		 362 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  31.02 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1406  adenosine deaminase  29.09 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000107989  hitchhiker  2.2737200000000002e-26 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  29.48 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0686  adenosine deaminase  30.4 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  31.36 
 
 		 362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  31.36 
 
 		 362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  30.88 
 
 		 362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  31.36 
 
 		 362 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  28.31 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  30.75 
 
 		 363 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  29.14 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  31.8 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  31.63 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>