274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1299 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  100 
 
 
325 aa  633  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  57.1 
 
 
328 aa  325  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  52 
 
 
333 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  47.01 
 
 
349 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  46.71 
 
 
342 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  45.07 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0674  adenosine deaminase  41.92 
 
 
343 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0226748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  41.32 
 
 
398 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3173  adenosine deaminase  42.06 
 
 
378 aa  228  8e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  41.62 
 
 
350 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  41.87 
 
 
349 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  40.65 
 
 
384 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  41.76 
 
 
358 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0572  adenosine deaminase  42.48 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00357349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0605  adenosine deaminase  40.59 
 
 
340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.624245  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24030  adenosine deaminase  42.09 
 
 
343 aa  218  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  42.14 
 
 
342 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4085  adenosine deaminase  44.07 
 
 
330 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  43.09 
 
 
368 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  41.72 
 
 
336 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  36.39 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  38.94 
 
 
325 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3645  adenosine deaminase  39.74 
 
 
336 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  37.75 
 
 
353 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0534  adenosine deaminase  42.96 
 
 
360 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.125477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  38.69 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  35.26 
 
 
317 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  34.82 
 
 
315 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  36.45 
 
 
378 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  38.51 
 
 
340 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  34.84 
 
 
315 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  33.66 
 
 
316 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  34.3 
 
 
316 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  34.84 
 
 
318 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  35.16 
 
 
315 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  34.71 
 
 
315 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  34.84 
 
 
317 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  36.39 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  36.94 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  35.42 
 
 
341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  36.48 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  34.22 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  38.61 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  36.42 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  33.66 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  35.96 
 
 
322 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  34.63 
 
 
341 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  34.63 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  34.63 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  33.95 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  31.86 
 
 
354 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  33.86 
 
 
366 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  34.03 
 
 
341 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  34.03 
 
 
341 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  34.03 
 
 
341 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  34.03 
 
 
341 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  30.39 
 
 
326 aa  162  9e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  34.65 
 
 
334 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  34.38 
 
 
346 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  30.39 
 
 
326 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  32.93 
 
 
365 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  35.74 
 
 
327 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  35.74 
 
 
327 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  34.91 
 
 
337 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  33.04 
 
 
339 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  33.43 
 
 
341 aa  158  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  35.74 
 
 
366 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  36.97 
 
 
332 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  35.86 
 
 
359 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  35.74 
 
 
342 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  33.44 
 
 
349 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  34.72 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  34.43 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  33.86 
 
 
322 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  34.42 
 
 
348 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  31.82 
 
 
350 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4101  Adenosine deaminase  36.11 
 
 
329 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  32.52 
 
 
346 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  35.5 
 
 
331 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  31.83 
 
 
350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  38.51 
 
 
352 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  32.53 
 
 
341 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  36.31 
 
 
332 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  33.33 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  33.33 
 
 
335 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  32.23 
 
 
341 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  32.58 
 
 
345 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  32.93 
 
 
355 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  31.64 
 
 
338 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  36.68 
 
 
328 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  31.93 
 
 
341 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  36.24 
 
 
322 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  35.67 
 
 
356 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  32.23 
 
 
341 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  34.53 
 
 
357 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  33.23 
 
 
354 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  35.03 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  34.57 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  32.23 
 
 
682 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  32.23 
 
 
682 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>