266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3742 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  100 
 
 		 356 aa  722    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  75.29 
 
 		 357 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  70.7 
 
 		 365 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  70.92 
 
 		 355 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  70.49 
 
 		 375 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  72.04 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  71.9 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  69.73 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  68.27 
 
 		 360 aa  471  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  70.96 
 
 		 350 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  70.3 
 
 		 350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  66.67 
 
 		 346 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  66.77 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  65.75 
 
 		 350 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  66.77 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  65.96 
 
 		 343 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  66.15 
 
 		 341 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  66.15 
 
 		 341 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  66.07 
 
 		 345 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  66.06 
 
 		 350 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  66.15 
 
 		 341 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  66.15 
 
 		 341 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  65.85 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  67.19 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  67.51 
 
 		 682 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  66.15 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  67.51 
 
 		 682 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  67.51 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  65.85 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  65.85 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  65.85 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  67.69 
 
 		 351 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  67.73 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  64.72 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  65.54 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  65.23 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  57.93 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  56.23 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  59.27 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  56.44 
 
 		 337 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  60.73 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  56.83 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  61.49 
 
 		 315 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  60.13 
 
 		 335 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  58.04 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  59.29 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  56.33 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  60.77 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  58.73 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  53.89 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  59.29 
 
 		 315 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  59.29 
 
 		 315 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  59.42 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  61.92 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  53.96 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  58.79 
 
 		 317 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  58.97 
 
 		 315 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  58.79 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  59.15 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  55.49 
 
 		 336 aa  378  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  56.75 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  57.51 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  59.11 
 
 		 316 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  54.52 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  57.36 
 
 		 378 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  54.94 
 
 		 335 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  53.54 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  53.47 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  56.83 
 
 		 329 aa  358  8e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  49.7 
 
 		 330 aa  355  1e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  51.52 
 
 		 335 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  54.04 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  54.04 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  57.58 
 
 		 328 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  54.1 
 
 		 341 aa  332  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  48.78 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  50.32 
 
 		 341 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  47.42 
 
 		 343 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  49.38 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  44.85 
 
 		 346 aa  295  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  45.45 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  46.06 
 
 		 337 aa  288  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  46.63 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  46.36 
 
 		 342 aa  285  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  44.57 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  46.6 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  44.41 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59156  adenine aminohydrolase (adenine deaminase)  42.01 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0307453 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06078  Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4)(Adenosine aminohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8X1T6]  41.62 
 
 		 364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl215  adenosine deaminase  32.52 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  39.01 
 
 		 352 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  40.15 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  31.82 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  36.48 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  31.42 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  38 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  33.23 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  29.85 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  29.54 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  32.98 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>