277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2196 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  100 
 
 
366 aa  731    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  49.1 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  51.96 
 
 
340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  51.96 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  50 
 
 
360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  48.24 
 
 
348 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  49.56 
 
 
352 aa  269  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  45.72 
 
 
342 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  46.2 
 
 
332 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  39.76 
 
 
346 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  38.87 
 
 
366 aa  225  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  38.46 
 
 
346 aa  222  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  42.86 
 
 
368 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  37.3 
 
 
353 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  35.55 
 
 
354 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  37.94 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  37.11 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  37.65 
 
 
347 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  37.65 
 
 
347 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  35.38 
 
 
335 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  39.09 
 
 
329 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  35.08 
 
 
337 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  34.46 
 
 
350 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  34.53 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  31.52 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  36.62 
 
 
339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  37.07 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  39.81 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  38.18 
 
 
336 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  34.46 
 
 
350 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  37.89 
 
 
343 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  38.3 
 
 
328 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  36.23 
 
 
334 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  36 
 
 
335 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  36.48 
 
 
356 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  33.9 
 
 
365 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  36.2 
 
 
341 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0534  adenosine deaminase  39.01 
 
 
360 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.125477 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  35.43 
 
 
376 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  36.31 
 
 
325 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  34.97 
 
 
345 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  35.46 
 
 
315 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  32.72 
 
 
336 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  36.22 
 
 
354 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  32.08 
 
 
335 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  36.25 
 
 
376 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  33.64 
 
 
360 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  35.09 
 
 
361 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  35.65 
 
 
338 aa  176  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  33.12 
 
 
346 aa  176  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  33.54 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  31.85 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  35.35 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  34.15 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  31.76 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  35.35 
 
 
350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  34.48 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  32.85 
 
 
375 aa  173  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  35.65 
 
 
376 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  35.67 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  34.15 
 
 
341 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  35.4 
 
 
351 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  33.43 
 
 
341 aa  172  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  29.94 
 
 
332 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  34.15 
 
 
682 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  33.23 
 
 
341 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  34.15 
 
 
682 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  31.71 
 
 
335 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  34.73 
 
 
344 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  33.85 
 
 
341 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  33.96 
 
 
341 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  33.64 
 
 
341 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  33.54 
 
 
341 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  33.54 
 
 
341 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  35.84 
 
 
341 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  33.54 
 
 
341 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  33.54 
 
 
341 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  34.03 
 
 
343 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  33.54 
 
 
341 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  37.08 
 
 
359 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  33.54 
 
 
341 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  33.54 
 
 
341 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  38.31 
 
 
328 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  34.11 
 
 
374 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  35.59 
 
 
317 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  34.64 
 
 
353 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  37.42 
 
 
339 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  35.62 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  35.25 
 
 
317 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  34.49 
 
 
350 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  31.93 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  32.52 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  35.15 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  34.8 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  34.69 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  34.8 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  35.25 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  35.25 
 
 
315 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  34.8 
 
 
345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  35.25 
 
 
318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>