281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2867 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  100 
 
 
353 aa  715    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  82.34 
 
 
366 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  58.55 
 
 
346 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  53.53 
 
 
346 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  38.62 
 
 
354 aa  256  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  43.59 
 
 
368 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  36.98 
 
 
342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0534  adenosine deaminase  44.55 
 
 
360 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.125477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  35.22 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  34.63 
 
 
340 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  38.98 
 
 
332 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  35.67 
 
 
374 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  37.3 
 
 
366 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  35.54 
 
 
335 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  34.23 
 
 
337 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  35.48 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  39.93 
 
 
336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  34.9 
 
 
376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  34.9 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  35.24 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  39.94 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  34.06 
 
 
339 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  35.22 
 
 
348 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  33.13 
 
 
350 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  33.33 
 
 
345 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  35.29 
 
 
353 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  29.91 
 
 
328 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  30.38 
 
 
335 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  38.13 
 
 
334 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  32.39 
 
 
393 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  36.03 
 
 
357 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  28.3 
 
 
332 aa  189  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  30.15 
 
 
326 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  35.35 
 
 
336 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  35.48 
 
 
329 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  32.84 
 
 
375 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  34.89 
 
 
322 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  29.78 
 
 
335 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  34.85 
 
 
359 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  31.58 
 
 
338 aa  186  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  34.18 
 
 
354 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  29.54 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  32.94 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  33.85 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  32.94 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  35.02 
 
 
322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  33.65 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  33.43 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  34.19 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  31.91 
 
 
315 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  35.44 
 
 
351 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  33.64 
 
 
345 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  36.04 
 
 
341 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  33.64 
 
 
350 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  31.27 
 
 
317 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  32.81 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  31.27 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  31.92 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  31.23 
 
 
338 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  31 
 
 
361 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  34.83 
 
 
364 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  29.47 
 
 
335 aa  179  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  31.27 
 
 
315 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  33.44 
 
 
345 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  33.12 
 
 
343 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  33.03 
 
 
345 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  36.65 
 
 
328 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  37.85 
 
 
322 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  36.74 
 
 
331 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  31.27 
 
 
315 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  32.1 
 
 
343 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  30.5 
 
 
338 aa  176  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  30.53 
 
 
336 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  33.54 
 
 
331 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  37 
 
 
328 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  27.62 
 
 
332 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  30.94 
 
 
315 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  33.64 
 
 
331 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  33.64 
 
 
331 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  26.61 
 
 
330 aa  176  7e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  30.94 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  31.33 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  30.94 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  33.33 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  34.04 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  33.33 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  38.57 
 
 
325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  31.27 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  33.23 
 
 
334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  37.75 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  32.92 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  30.94 
 
 
317 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  32.94 
 
 
359 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  33.33 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  31.71 
 
 
331 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  29.34 
 
 
337 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  33.33 
 
 
331 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  32.71 
 
 
341 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0264  adenosine deaminase  38.85 
 
 
356 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  34.16 
 
 
337 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>