273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0534 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0534  adenosine deaminase  100 
 
 		 360 aa  706    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.125477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  76.23 
 
 		 368 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  57.76 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0264  adenosine deaminase  54.49 
 
 		 356 aa  288  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  44.88 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  44.55 
 
 		 353 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  45.74 
 
 		 332 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  40.24 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4101  Adenosine deaminase  42.72 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  43.62 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  40.21 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  40.77 
 
 		 366 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  38.99 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  42.96 
 
 		 325 aa  199  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  43.38 
 
 		 328 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  38.99 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  32.61 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  36 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  37.3 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  38.91 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  40.83 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  40.36 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  40.51 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  33.58 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  38.03 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  36.76 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  39.05 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  40.88 
 
 		 354 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  39.19 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  42.52 
 
 		 352 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  36.91 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  33.21 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  44.53 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  39.05 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  36.83 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  38.23 
 
 		 348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  39.42 
 
 		 349 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  36.49 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  35.99 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  35.99 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  35.22 
 
 		 347 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  35.22 
 
 		 347 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  36.89 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  35.99 
 
 		 318 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  35.99 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  39.05 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  33.54 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  37.82 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  37.71 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  37.02 
 
 		 316 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06078  Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4)(Adenosine aminohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8X1T6]  34.81 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  37.02 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  39.78 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  35.47 
 
 		 360 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  36.5 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  36.93 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59156  adenine aminohydrolase (adenine deaminase)  32.63 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0307453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  36.73 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  35.64 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  36.33 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  37.2 
 
 		 337 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  36.88 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  36.88 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  32.85 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  34.95 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  33.56 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  29.72 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  36.88 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  36.88 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  36.88 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  36.88 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  36.88 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  38.36 
 
 		 360 aa  173  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  38.41 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  39.27 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  32.59 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  36.5 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  37.05 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  29.78 
 
 		 335 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  29.93 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  35.89 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  36 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  36.14 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  37.66 
 
 		 324 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  36.24 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  36.88 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  36.71 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  33.86 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  31.53 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  36.71 
 
 		 359 aa  169  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  31.96 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  34.82 
 
 		 341 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  31.86 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  34.82 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  35.23 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  35.62 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  35.96 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  36.99 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  36.08 
 
 		 682 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>