282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1779 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  100 
 
 		 340 aa  680    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  94.41 
 
 		 340 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  63.58 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  67.47 
 
 		 360 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  64.12 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  52.25 
 
 		 342 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  51.96 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  51.32 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  48.81 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  36.31 
 
 		 354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  40.06 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  35.22 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  39.88 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  34.72 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  35.71 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  39.38 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  39.14 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  36.12 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  33.74 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  31.52 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  34.36 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  34.95 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  38.7 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  34.83 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  31.64 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  35.08 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  35.89 
 
 		 351 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  33.14 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  31.74 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  34.91 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  35.33 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  33.92 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  36.79 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  31.04 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  33.82 
 
 		 361 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  34.45 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  32.18 
 
 		 336 aa  179  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  35.91 
 
 		 357 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  34.52 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  32.12 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  32.73 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  35.06 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  37.11 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  37.03 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0534  adenosine deaminase  38.99 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.125477 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  32.34 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  37.69 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  31.52 
 
 		 326 aa  175  9e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  35.01 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  33.54 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  35.01 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  35.38 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  32.94 
 
 		 349 aa  173  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  29.29 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  31.29 
 
 		 326 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  35.1 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  35.4 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  35.29 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  36.99 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  33.84 
 
 		 341 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  33.53 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  31.68 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  33.75 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  37.54 
 
 		 328 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  29.08 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  33.84 
 
 		 682 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  33.84 
 
 		 682 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  32.04 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  32.12 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  32.11 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  34.78 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  34.13 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  31.55 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  32.33 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  31.13 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  30.86 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  31.25 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  31.56 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  30.82 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  31.1 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  35.37 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  31.52 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  30.75 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  36 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  33.23 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  30.72 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  36.53 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  31.35 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  31.13 
 
 		 316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  35.56 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  31.45 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  31.25 
 
 		 317 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  30.43 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  32.93 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  31.64 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  35.57 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  32.63 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  35.21 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  30.61 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  35.57 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>