277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2323 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  100 
 
 
334 aa  685    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  85.89 
 
 
334 aa  604  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  85.59 
 
 
334 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  74.23 
 
 
333 aa  521  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  71.43 
 
 
334 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  71.43 
 
 
334 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  71.12 
 
 
332 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  69.07 
 
 
333 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  69.07 
 
 
333 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  69.07 
 
 
333 aa  488  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  69.79 
 
 
333 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  69.07 
 
 
333 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  69.79 
 
 
333 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  69.49 
 
 
333 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  69.79 
 
 
333 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  69.07 
 
 
333 aa  488  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  69.79 
 
 
333 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  69.07 
 
 
333 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  69.63 
 
 
332 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  69.07 
 
 
333 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  68.77 
 
 
333 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  70.21 
 
 
337 aa  484  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  68.77 
 
 
333 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  68.69 
 
 
337 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  66.87 
 
 
337 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  65.26 
 
 
331 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  64.95 
 
 
331 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  64.65 
 
 
331 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  64.65 
 
 
331 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  64.94 
 
 
331 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  65.67 
 
 
337 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  64.02 
 
 
331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  64.33 
 
 
331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  64.02 
 
 
331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  63.72 
 
 
331 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  64.05 
 
 
331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  63.55 
 
 
332 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  64.65 
 
 
331 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  64.05 
 
 
332 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  58.72 
 
 
331 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  38.77 
 
 
374 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  38.44 
 
 
376 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  38.53 
 
 
359 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  38.14 
 
 
376 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  38.14 
 
 
376 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  36.11 
 
 
393 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  34.77 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  32.15 
 
 
354 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  33.44 
 
 
353 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  31.91 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  32.72 
 
 
337 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  31.58 
 
 
340 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  32.11 
 
 
346 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  31.08 
 
 
340 aa  165  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  31.52 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  29.91 
 
 
331 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  30.91 
 
 
332 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  32.16 
 
 
356 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  30.77 
 
 
331 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  33.63 
 
 
366 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  33.44 
 
 
336 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  32.24 
 
 
362 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  32.93 
 
 
364 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  31.94 
 
 
359 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  31.14 
 
 
364 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  34.95 
 
 
332 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0686  adenosine deaminase  31.19 
 
 
366 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  31.1 
 
 
350 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  30.18 
 
 
358 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1362  adenosine deaminase  28.87 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  31.99 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  31.45 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  29.14 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1162  adenosine deaminase  29.92 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2936  adenosine deaminase  28.9 
 
 
372 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000510583  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  31.25 
 
 
348 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  33.14 
 
 
360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  30.27 
 
 
362 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  27.86 
 
 
328 aa  145  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  29.1 
 
 
335 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  28.79 
 
 
365 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1406  adenosine deaminase  29.79 
 
 
333 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000107989  hitchhiker  2.2737200000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  30.56 
 
 
346 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  31.96 
 
 
367 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  29.13 
 
 
363 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  30.3 
 
 
364 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  31.21 
 
 
350 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  27.84 
 
 
338 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0321  adenosine deaminase  31.85 
 
 
344 aa  143  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.949208  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1002  adenosine deaminase  31.62 
 
 
367 aa  142  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1145  adenosine deaminase  31.83 
 
 
381 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.605319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  29.38 
 
 
357 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  28.44 
 
 
345 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0789  adenosine deaminase  31.27 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1027  adenosine deaminase  31.7 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3533  adenosine deaminase  30.7 
 
 
373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0451471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  35.42 
 
 
360 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  30.88 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  29.24 
 
 
372 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  29.72 
 
 
356 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>