286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4117 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  95.76 
 
 
331 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  97.27 
 
 
331 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  95.45 
 
 
331 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  98.49 
 
 
331 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  96.06 
 
 
331 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  99.7 
 
 
331 aa  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  99.09 
 
 
331 aa  673    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  95.15 
 
 
331 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  100 
 
 
331 aa  681    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  90.33 
 
 
331 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  87.61 
 
 
331 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  85.24 
 
 
332 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  81.87 
 
 
332 aa  554  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  65.34 
 
 
334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  65.22 
 
 
334 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  65.55 
 
 
334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  63.8 
 
 
332 aa  441  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  62.88 
 
 
334 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  62.88 
 
 
334 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  62.88 
 
 
333 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  62.27 
 
 
332 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  62.88 
 
 
333 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  62.88 
 
 
333 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  61.96 
 
 
333 aa  431  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  62.58 
 
 
333 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  62.58 
 
 
333 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  62.88 
 
 
333 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  62.58 
 
 
333 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  62.58 
 
 
333 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  62.58 
 
 
333 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  62.58 
 
 
333 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  62.27 
 
 
333 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  62.58 
 
 
333 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  62.27 
 
 
333 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  61.66 
 
 
333 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  62.2 
 
 
337 aa  417  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  60.74 
 
 
337 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  59.51 
 
 
337 aa  411  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  59.08 
 
 
337 aa  401  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  56.06 
 
 
331 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  34.98 
 
 
374 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  36.53 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  35.09 
 
 
376 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  35.09 
 
 
376 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  34.78 
 
 
376 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  35.4 
 
 
366 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  35.08 
 
 
393 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  34.5 
 
 
354 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  33.74 
 
 
346 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  33.64 
 
 
353 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  31.6 
 
 
337 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  33.33 
 
 
348 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  31.48 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  32.32 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  30.75 
 
 
340 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  34.34 
 
 
356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  30.34 
 
 
332 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  29.63 
 
 
331 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  29.01 
 
 
331 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  30.03 
 
 
332 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0321  adenosine deaminase  31.36 
 
 
344 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.949208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  33.33 
 
 
366 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  34.23 
 
 
362 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  32.84 
 
 
362 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  32.46 
 
 
372 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  33.04 
 
 
362 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  32.5 
 
 
332 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  33.04 
 
 
362 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  33.04 
 
 
362 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  32.34 
 
 
359 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  32.43 
 
 
363 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1002  adenosine deaminase  33.63 
 
 
367 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  33.33 
 
 
364 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  32.42 
 
 
364 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  29.1 
 
 
331 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  32.64 
 
 
362 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  32.54 
 
 
367 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  30.43 
 
 
336 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  32.94 
 
 
360 aa  150  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1162  adenosine deaminase  30 
 
 
402 aa  150  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  30.77 
 
 
342 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1362  adenosine deaminase  31.07 
 
 
360 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  31.75 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  31.34 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  30.28 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0759  adenosine deaminase  32.02 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  30.63 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  35.16 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  30.7 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  31.8 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2936  adenosine deaminase  32.92 
 
 
372 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000510583  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1027  adenosine deaminase  32.64 
 
 
371 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  29.45 
 
 
329 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1781  adenosine deaminase  31.62 
 
 
369 aa  146  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  29.6 
 
 
343 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  31.61 
 
 
368 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  27.36 
 
 
326 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1320  adenosine deaminase  33.14 
 
 
363 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0285514  normal  0.854573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3533  adenosine deaminase  32.74 
 
 
373 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0451471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  33.33 
 
 
333 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>