280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2007 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  100 
 
 		 333 aa  679    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  100 
 
 		 333 aa  679    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  98.8 
 
 		 333 aa  671    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  100 
 
 		 333 aa  679    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  98.8 
 
 		 333 aa  671    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  99.4 
 
 		 333 aa  676    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  679    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  100 
 
 		 333 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  100 
 
 		 333 aa  679    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  90.06 
 
 		 333 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  90.06 
 
 		 333 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  90.06 
 
 		 333 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  89.76 
 
 		 333 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  89.76 
 
 		 333 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  87.01 
 
 		 332 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  77.27 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  77.27 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  77.58 
 
 		 332 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  70.78 
 
 		 337 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  71.6 
 
 		 337 aa  491  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  72.07 
 
 		 337 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  71.77 
 
 		 337 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  68.47 
 
 		 334 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  69.88 
 
 		 334 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  68.79 
 
 		 334 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  64.33 
 
 		 333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  62.88 
 
 		 331 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  62.58 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  61.66 
 
 		 331 aa  424  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  62.27 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  61.04 
 
 		 331 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  61.04 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  61.66 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  60.74 
 
 		 331 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  60.74 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  62.39 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  61.04 
 
 		 331 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  61.35 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  55.83 
 
 		 331 aa  398  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  60.12 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  37.58 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  34.95 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  35.87 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  34.66 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  34.36 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  34.36 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  32.33 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  31.19 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  31.94 
 
 		 354 aa  169  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  39.71 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  33.23 
 
 		 364 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  32.1 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  32.04 
 
 		 362 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  32.54 
 
 		 367 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  32.54 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  32.34 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  31.68 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  31.71 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  32.94 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  31.31 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  31.93 
 
 		 356 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  28.92 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  29.05 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  32.06 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  29.57 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  31.16 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0789  adenosine deaminase  33.63 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  30.03 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3533  adenosine deaminase  31.25 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0451471  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  30.63 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  31.61 
 
 		 346 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  30.46 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0759  adenosine deaminase  31.36 
 
 		 364 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  31.47 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  31.5 
 
 		 343 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  31.47 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  31.47 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  32.63 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  33.02 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  30.61 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  31.12 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  32.28 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  32.72 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  27.74 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  29.56 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1362  adenosine deaminase  29.2 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  31.76 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  30.27 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2936  adenosine deaminase  31.79 
 
 		 372 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000510583  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1320  adenosine deaminase  31.29 
 
 		 363 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0285514  normal  0.854573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  32.07 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0686  adenosine deaminase  29.91 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  28.84 
 
 		 328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  30.65 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  27.22 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  27.52 
 
 		 326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  31.93 
 
 		 345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  29.58 
 
 		 316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  30.99 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>