267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3887 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  100 
 
 		 365 aa  751    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  82.6 
 
 		 360 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  81.71 
 
 		 346 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  76.55 
 
 		 375 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  75.52 
 
 		 349 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  76.7 
 
 		 350 aa  532  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  76.47 
 
 		 350 aa  527  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  72.89 
 
 		 345 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  75 
 
 		 357 aa  511  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  70.7 
 
 		 356 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  67.16 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  66.86 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  66.87 
 
 		 343 aa  464  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  68.92 
 
 		 341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  68.31 
 
 		 341 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  67.08 
 
 		 341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  67.69 
 
 		 341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  63.06 
 
 		 682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  67.38 
 
 		 341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  63.06 
 
 		 682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  65.54 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  67.08 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  66.77 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  65.85 
 
 		 350 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  65.54 
 
 		 350 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  66.57 
 
 		 345 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  67.08 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  66.27 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  66.77 
 
 		 341 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  66.77 
 
 		 341 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  66.36 
 
 		 351 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  66.35 
 
 		 354 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  66.77 
 
 		 341 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  66.77 
 
 		 341 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  66.77 
 
 		 341 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  65.27 
 
 		 345 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  61.98 
 
 		 315 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  63.52 
 
 		 315 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  61.06 
 
 		 335 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  62.3 
 
 		 317 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  57.67 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  62.62 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  62.62 
 
 		 316 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  61.34 
 
 		 315 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  61.34 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  61.66 
 
 		 315 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  63.19 
 
 		 315 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  61.66 
 
 		 317 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  60.06 
 
 		 317 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  61.04 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  59.76 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  57.59 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  61.7 
 
 		 334 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  55.94 
 
 		 335 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  54.49 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  55.7 
 
 		 339 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  53.4 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  56.67 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  56.06 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  56.43 
 
 		 337 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  57.66 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  53.75 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  52.6 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  52.47 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  52.21 
 
 		 361 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  55.9 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  52.76 
 
 		 343 aa  363  3e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  52.4 
 
 		 347 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  52.4 
 
 		 347 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  54.75 
 
 		 378 aa  355  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  50.93 
 
 		 341 aa  350  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  48.33 
 
 		 330 aa  349  4e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  53.09 
 
 		 353 aa  338  9e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  56.52 
 
 		 328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  47.73 
 
 		 338 aa  335  5e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  48.92 
 
 		 341 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  52.76 
 
 		 341 aa  332  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  48.01 
 
 		 338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  47.6 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  45.18 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  48.63 
 
 		 342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  47.13 
 
 		 333 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  46.06 
 
 		 348 aa  302  6.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  46.81 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  44.17 
 
 		 346 aa  298  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  45.37 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59156  adenine aminohydrolase (adenine deaminase)  43.98 
 
 		 355 aa  275  7e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0307453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  46.88 
 
 		 341 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06078  Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4)(Adenosine aminohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8X1T6]  40.06 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl215  adenosine deaminase  32.42 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  32.92 
 
 		 346 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  39.46 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  38.98 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  32.94 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  33.65 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  32.01 
 
 		 366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  33.9 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0534  adenosine deaminase  37.7 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.125477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  34.98 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  37.96 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>