280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0385 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  100 
 
 
336 aa  673    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  40.73 
 
 
337 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  40 
 
 
340 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  39.38 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  35.54 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  36.31 
 
 
366 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  35.8 
 
 
354 aa  208  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  38.07 
 
 
342 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  35.35 
 
 
353 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  38.07 
 
 
366 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  35.19 
 
 
341 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  35.19 
 
 
341 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  35.42 
 
 
682 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  35.42 
 
 
682 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  39.5 
 
 
336 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  36.19 
 
 
339 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  35.57 
 
 
341 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  34.99 
 
 
341 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  36.78 
 
 
360 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  41.01 
 
 
352 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  35.78 
 
 
334 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  34.24 
 
 
341 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  33.13 
 
 
337 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  36.89 
 
 
329 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  35.87 
 
 
341 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  35.83 
 
 
325 aa  185  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  33.02 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  39.5 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  32.39 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  34.25 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  32.72 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  36.86 
 
 
327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  36.86 
 
 
327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  34.41 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  30.98 
 
 
339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  33.65 
 
 
317 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  33.33 
 
 
317 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  36.05 
 
 
343 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  33.12 
 
 
318 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  33.33 
 
 
316 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  35.19 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  37.25 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  35.19 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  33.01 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  32.69 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  34.16 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  30.37 
 
 
335 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  31.29 
 
 
335 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  33.33 
 
 
346 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  33.01 
 
 
315 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  29.97 
 
 
330 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  37.42 
 
 
322 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  36.22 
 
 
325 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  34.25 
 
 
350 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  32.2 
 
 
365 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  38.17 
 
 
332 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  33.23 
 
 
346 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  32.69 
 
 
315 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  32.72 
 
 
335 aa  175  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  34.08 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  36.45 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  32.15 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  30.67 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  31.73 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  33.43 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  35.05 
 
 
327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  33.14 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  31.69 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  33.14 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  33.14 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  35.62 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  36.06 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  32.42 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  36.27 
 
 
357 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  32.1 
 
 
338 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  36.84 
 
 
322 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  32.32 
 
 
333 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  32.84 
 
 
341 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  32.32 
 
 
333 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  32.84 
 
 
341 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  33.23 
 
 
332 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  32.72 
 
 
334 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  32.84 
 
 
341 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  32.72 
 
 
334 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  32.84 
 
 
341 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  32.32 
 
 
333 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  34.04 
 
 
351 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  32.14 
 
 
354 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  33.43 
 
 
375 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  32.52 
 
 
350 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  32.01 
 
 
333 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  31.99 
 
 
360 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  32.01 
 
 
333 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  31.71 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  35.67 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  29.66 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  31.71 
 
 
333 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  31.71 
 
 
333 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  31.71 
 
 
333 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  31.71 
 
 
333 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>