284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1459 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  100 
 
 
332 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  50.75 
 
 
340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  50.15 
 
 
340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  50.45 
 
 
342 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  48.06 
 
 
337 aa  288  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  49.71 
 
 
348 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  48.04 
 
 
360 aa  277  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  45.92 
 
 
366 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  39.12 
 
 
354 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  40.82 
 
 
366 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  44.85 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  38.14 
 
 
353 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  36.7 
 
 
346 aa  202  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  41.69 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  35.63 
 
 
346 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0534  adenosine deaminase  43.53 
 
 
360 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.125477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  37.61 
 
 
329 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  41.61 
 
 
336 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  37.77 
 
 
336 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  28.01 
 
 
330 aa  171  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  39.29 
 
 
328 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  29.97 
 
 
326 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  36.36 
 
 
398 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  36.97 
 
 
325 aa  165  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  30.45 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  35.4 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  35.42 
 
 
322 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  36.98 
 
 
342 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  32.12 
 
 
378 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  30.21 
 
 
393 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  35.69 
 
 
325 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  28.48 
 
 
335 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  33.93 
 
 
334 aa  159  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  35.17 
 
 
333 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  34.14 
 
 
332 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  37.15 
 
 
327 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  32.4 
 
 
354 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  37.43 
 
 
358 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  29.73 
 
 
335 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  37.84 
 
 
349 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0264  adenosine deaminase  38.41 
 
 
356 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  32.63 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  32.12 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  28.79 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  30.09 
 
 
349 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  35.44 
 
 
325 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  36.45 
 
 
349 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  35.8 
 
 
328 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  34.94 
 
 
350 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  31.08 
 
 
346 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  29.97 
 
 
361 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0674  adenosine deaminase  35.87 
 
 
343 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0226748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  30.98 
 
 
350 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  31.36 
 
 
331 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  31.66 
 
 
331 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  31.44 
 
 
349 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  30.38 
 
 
341 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  27.83 
 
 
332 aa  150  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  30.7 
 
 
338 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4085  adenosine deaminase  36.98 
 
 
330 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  30.51 
 
 
355 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  30.79 
 
 
337 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  31.66 
 
 
331 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  30.31 
 
 
315 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  30.61 
 
 
331 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  31.08 
 
 
335 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  31.6 
 
 
365 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  31.99 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  29.36 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  36.94 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  31.66 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  30.46 
 
 
350 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  32.34 
 
 
359 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  30.61 
 
 
343 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  31.36 
 
 
331 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  31.36 
 
 
331 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  31.36 
 
 
331 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  27.22 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  31.8 
 
 
353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  31.36 
 
 
331 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  32.92 
 
 
324 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  36.31 
 
 
342 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  31.16 
 
 
331 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  32.49 
 
 
345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  32.12 
 
 
341 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  30.03 
 
 
341 aa  145  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  28.05 
 
 
339 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  32.11 
 
 
356 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  31.02 
 
 
374 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  35.53 
 
 
327 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  32.04 
 
 
341 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  31.36 
 
 
331 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  35.53 
 
 
327 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  31.64 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  31.35 
 
 
375 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  31.95 
 
 
376 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  30.86 
 
 
341 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  24.92 
 
 
332 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0605  adenosine deaminase  37.28 
 
 
340 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.624245  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  29.27 
 
 
348 aa  143  5e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>