282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0278 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  100 
 
 
327 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  92.66 
 
 
327 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  92.35 
 
 
327 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  65.22 
 
 
331 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  62.11 
 
 
325 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  62.31 
 
 
322 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  45.34 
 
 
325 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  46.89 
 
 
322 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  47.6 
 
 
322 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  44.06 
 
 
324 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  37.54 
 
 
326 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  37.23 
 
 
326 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  40.68 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  38.55 
 
 
354 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  36.42 
 
 
350 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  39.08 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  36.42 
 
 
346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  35.8 
 
 
341 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  35.8 
 
 
341 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  35.96 
 
 
343 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  35.8 
 
 
341 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  35.8 
 
 
341 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  35.8 
 
 
341 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  35.8 
 
 
341 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  36.11 
 
 
350 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  37.35 
 
 
341 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  36.28 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  36.28 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  35.49 
 
 
341 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  36.42 
 
 
341 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  36.31 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  36.28 
 
 
682 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  36.28 
 
 
682 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  36.09 
 
 
346 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  36.34 
 
 
357 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0674  adenosine deaminase  35.2 
 
 
343 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0226748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  35.49 
 
 
341 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  39.26 
 
 
348 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  35.19 
 
 
341 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  36.33 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  35.06 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  36.14 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  34.28 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  33.65 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  33.94 
 
 
346 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  35.02 
 
 
337 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  38.68 
 
 
328 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  33.95 
 
 
349 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  31.99 
 
 
337 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  35.33 
 
 
353 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  31.13 
 
 
335 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  34.15 
 
 
351 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  35.71 
 
 
316 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  33.23 
 
 
341 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  33.23 
 
 
334 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  33.96 
 
 
345 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  34.09 
 
 
315 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  33.77 
 
 
315 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  32.49 
 
 
346 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  34.09 
 
 
318 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  33.55 
 
 
317 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  35.37 
 
 
366 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  36.56 
 
 
340 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  33.33 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  34.74 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  35.69 
 
 
339 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  29.72 
 
 
330 aa  166  5e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  33.65 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  30.84 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  30.31 
 
 
332 aa  165  8e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  33.02 
 
 
360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  36.39 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  36.69 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  33.75 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  34.19 
 
 
317 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  30.45 
 
 
335 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  33.44 
 
 
358 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  35.09 
 
 
398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  30.03 
 
 
339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  35.05 
 
 
336 aa  162  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  30.31 
 
 
335 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  36.76 
 
 
340 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  31.86 
 
 
336 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  33.02 
 
 
357 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  32.37 
 
 
345 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  36.02 
 
 
328 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  30.25 
 
 
336 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  33.44 
 
 
341 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  31.27 
 
 
328 aa  160  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  33.55 
 
 
317 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  33.86 
 
 
375 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  37.58 
 
 
325 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  37.67 
 
 
332 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  31.97 
 
 
355 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  33.12 
 
 
315 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  30.94 
 
 
349 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  34.52 
 
 
333 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  32.39 
 
 
338 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  33.54 
 
 
347 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  31.51 
 
 
361 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>