275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0890 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  91.38 
 
 		 351 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  100 
 
 		 354 aa  722    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  74.93 
 
 		 345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  74.64 
 
 		 345 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  73.47 
 
 		 345 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  69.55 
 
 		 341 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  68.66 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  68.36 
 
 		 341 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  68.66 
 
 		 341 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  68.66 
 
 		 341 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  68.66 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  68.66 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  68.66 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  66.67 
 
 		 350 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  66.96 
 
 		 350 aa  454  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  67.16 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  66.67 
 
 		 346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  67.46 
 
 		 341 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  66.87 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  66.87 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  66.87 
 
 		 682 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  66.87 
 
 		 341 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  66.87 
 
 		 682 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  66.57 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  68.85 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  63.47 
 
 		 349 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  67.87 
 
 		 357 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  65.23 
 
 		 355 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  66.98 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  66.77 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  65.77 
 
 		 349 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  66.35 
 
 		 365 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  68.45 
 
 		 350 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  63.89 
 
 		 345 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  65.22 
 
 		 350 aa  424  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  62.65 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  61.51 
 
 		 335 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  61.35 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  55.02 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  57.62 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  55.95 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  55.15 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  55.52 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  56.55 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  57.05 
 
 		 315 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  57.96 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  55.21 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  53.61 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  57.57 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  53.64 
 
 		 335 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  56.09 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  53.44 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  57.57 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  54.81 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  56.41 
 
 		 317 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  56.09 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  55.56 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  57.89 
 
 		 316 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  51.82 
 
 		 335 aa  361  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  57.89 
 
 		 316 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  55.45 
 
 		 317 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  56.09 
 
 		 317 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  54.13 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  54.19 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  55.21 
 
 		 329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  53.45 
 
 		 347 aa  352  5e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  53.45 
 
 		 347 aa  352  5e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  51.92 
 
 		 335 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  53.38 
 
 		 336 aa  348  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  52.16 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  52.35 
 
 		 341 aa  346  4e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  48.92 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  50.3 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  52.63 
 
 		 353 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  55.9 
 
 		 328 aa  336  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  47.71 
 
 		 338 aa  319  5e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  50 
 
 		 341 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  49.1 
 
 		 333 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  48.05 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  45.09 
 
 		 341 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  48.94 
 
 		 342 aa  302  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  47.35 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  43.29 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  47.45 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  46.27 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  44.82 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  42.99 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59156  adenine aminohydrolase (adenine deaminase)  42.2 
 
 		 355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0307453 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06078  Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4)(Adenosine aminohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8X1T6]  41.37 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  41.05 
 
 		 352 aa  208  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  34.14 
 
 		 346 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  35.44 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  35.93 
 
 		 337 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl215  adenosine deaminase  36.56 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  33.14 
 
 		 354 aa  192  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  33.84 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  40.51 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  34.18 
 
 		 353 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  37.11 
 
 		 324 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  35.33 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>