262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0773 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  100 
 
 
347 aa  707    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  100 
 
 
347 aa  707    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  59.13 
 
 
335 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  52.24 
 
 
360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  54.21 
 
 
345 aa  362  8e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  52.4 
 
 
365 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  53.58 
 
 
335 aa  358  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  54.98 
 
 
343 aa  358  8e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  55.21 
 
 
357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  54.18 
 
 
350 aa  355  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  51.44 
 
 
361 aa  355  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  54.49 
 
 
345 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  54.49 
 
 
345 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  52.82 
 
 
349 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  51.76 
 
 
349 aa  353  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  53.45 
 
 
354 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  53.13 
 
 
375 aa  352  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  53.19 
 
 
355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  52.74 
 
 
346 aa  351  8.999999999999999e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  52.76 
 
 
350 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  53.85 
 
 
350 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  53.37 
 
 
350 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  54.22 
 
 
345 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  54.05 
 
 
351 aa  348  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  50.76 
 
 
339 aa  348  9e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  54.04 
 
 
356 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  55.21 
 
 
341 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  49.85 
 
 
332 aa  345  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  52.94 
 
 
329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  50.88 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  53.92 
 
 
341 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  50.93 
 
 
338 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  53.92 
 
 
341 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  51.2 
 
 
339 aa  342  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  53.92 
 
 
682 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  53.61 
 
 
341 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  53.92 
 
 
682 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  53.31 
 
 
341 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  52.11 
 
 
341 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  52.71 
 
 
341 aa  338  7e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  49.23 
 
 
328 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  52.43 
 
 
315 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  51.28 
 
 
315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  48.06 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  51.6 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  50.46 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  51.6 
 
 
315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  52.98 
 
 
341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  51.81 
 
 
341 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  51.81 
 
 
341 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  52.24 
 
 
316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  52.24 
 
 
315 aa  336  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  52.12 
 
 
341 aa  335  9e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  51.28 
 
 
315 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  51.81 
 
 
341 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  51.52 
 
 
338 aa  333  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  51.81 
 
 
341 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  51.81 
 
 
341 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  51.81 
 
 
341 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  51.92 
 
 
316 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  49.21 
 
 
335 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  50 
 
 
317 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  50.32 
 
 
317 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  50.32 
 
 
317 aa  329  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  48.17 
 
 
335 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  48.2 
 
 
337 aa  328  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  48.18 
 
 
330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  47.16 
 
 
338 aa  325  6e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  50.94 
 
 
334 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  47.73 
 
 
341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  48.36 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  46.18 
 
 
335 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  47.22 
 
 
336 aa  316  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  47.2 
 
 
353 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  49.25 
 
 
339 aa  309  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  44.91 
 
 
343 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  56.99 
 
 
328 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  44.74 
 
 
341 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  43.37 
 
 
348 aa  291  1e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  45.99 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  45.97 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  42.48 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  41.76 
 
 
337 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  43.88 
 
 
337 aa  265  8.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  42.22 
 
 
344 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  41.57 
 
 
346 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  41.32 
 
 
342 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59156  adenine aminohydrolase (adenine deaminase)  36.49 
 
 
355 aa  232  9e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0307453 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06078  Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4)(Adenosine aminohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8X1T6]  35.61 
 
 
364 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140027  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  33.64 
 
 
346 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  33.93 
 
 
366 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  37.65 
 
 
366 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  37.46 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  32.94 
 
 
346 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  37.34 
 
 
368 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  32.94 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  33.73 
 
 
337 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  35.29 
 
 
340 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  35.01 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  34.06 
 
 
343 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>