277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1979 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  100 
 
 
331 aa  686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  61.66 
 
 
334 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  61.04 
 
 
334 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  58.01 
 
 
332 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  59.76 
 
 
333 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  57.67 
 
 
334 aa  404  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  57.67 
 
 
334 aa  404  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  58.39 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  55.83 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  55.83 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  56.1 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  55.83 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  55.83 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  57.27 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  56.36 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  55.83 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  55.83 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  55.52 
 
 
333 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  55.83 
 
 
333 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  56.75 
 
 
332 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  56.06 
 
 
331 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  57.36 
 
 
337 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  56.06 
 
 
331 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  55.76 
 
 
331 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  55.52 
 
 
332 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  55.83 
 
 
333 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  54.91 
 
 
333 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  55.83 
 
 
337 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  54.88 
 
 
337 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  55.83 
 
 
333 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  54.85 
 
 
331 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  54.55 
 
 
331 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  55.83 
 
 
333 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  55.83 
 
 
333 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  55.83 
 
 
333 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  55.15 
 
 
331 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  54.85 
 
 
331 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  54.85 
 
 
331 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  55.45 
 
 
331 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  54.91 
 
 
332 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  31.31 
 
 
374 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  31.1 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  31 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  31 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  30.7 
 
 
376 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  31.71 
 
 
353 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  31.71 
 
 
366 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  30.61 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  28.57 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  29.48 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  30.67 
 
 
336 aa  165  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  32.01 
 
 
337 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  32.3 
 
 
348 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  28.41 
 
 
354 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  30.37 
 
 
326 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  30.77 
 
 
359 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  30.03 
 
 
346 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  30.91 
 
 
356 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  29.19 
 
 
332 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  31.5 
 
 
332 aa  155  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  29.32 
 
 
340 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  29.61 
 
 
346 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  28.83 
 
 
331 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  29.15 
 
 
362 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  28.57 
 
 
332 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  29.63 
 
 
340 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  29.52 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  30.32 
 
 
367 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  28.75 
 
 
343 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  30.27 
 
 
342 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  29.14 
 
 
326 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  30.18 
 
 
364 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  28.74 
 
 
362 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  28.74 
 
 
362 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  28.74 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  28.11 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  28.75 
 
 
354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  29.5 
 
 
343 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  27.83 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  31.04 
 
 
366 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  28.83 
 
 
360 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  28.45 
 
 
362 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0686  adenosine deaminase  28.74 
 
 
366 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1406  adenosine deaminase  30.54 
 
 
333 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000107989  hitchhiker  2.2737200000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0759  adenosine deaminase  27.89 
 
 
364 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  28.49 
 
 
364 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  30.18 
 
 
349 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  28.26 
 
 
378 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  28.7 
 
 
362 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  28.88 
 
 
353 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  32.9 
 
 
332 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  28.31 
 
 
335 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  26.15 
 
 
335 aa  142  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  30.53 
 
 
368 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  29.17 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1027  adenosine deaminase  29.12 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  26.89 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1145  adenosine deaminase  29.58 
 
 
381 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.605319  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1320  adenosine deaminase  28.7 
 
 
363 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0285514  normal  0.854573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  28.12 
 
 
315 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>