264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3645 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3645  adenosine deaminase  100 
 
 
336 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  43 
 
 
328 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  37.06 
 
 
342 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  40.13 
 
 
325 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  37.24 
 
 
357 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  37.06 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0674  adenosine deaminase  37.28 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0226748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  34.62 
 
 
398 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  33.72 
 
 
350 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0605  adenosine deaminase  37.46 
 
 
340 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.624245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  38.12 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  34.32 
 
 
333 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  37.04 
 
 
325 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  38.91 
 
 
368 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  33.53 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  31.8 
 
 
322 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24030  adenosine deaminase  34.12 
 
 
343 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  35.67 
 
 
384 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  32.53 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  36.13 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  33.64 
 
 
327 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  32.63 
 
 
340 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3173  adenosine deaminase  35.19 
 
 
378 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  32.2 
 
 
324 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  31.12 
 
 
346 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  35.01 
 
 
358 aa  142  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0572  adenosine deaminase  34.5 
 
 
355 aa  142  9e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00357349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  32.43 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  32.19 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  35.09 
 
 
343 aa  139  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  31.25 
 
 
315 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  33.02 
 
 
327 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4085  adenosine deaminase  33.53 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  30.03 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  33.02 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  34.08 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  33.22 
 
 
353 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  31.31 
 
 
341 aa  135  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  35.65 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  35 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  31.79 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  34.97 
 
 
332 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  31.78 
 
 
329 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  28.62 
 
 
341 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  31.43 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  31.82 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  28.18 
 
 
335 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  31.95 
 
 
378 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  28.84 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0534  adenosine deaminase  38.23 
 
 
360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.125477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  27.36 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  31.51 
 
 
350 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  30.58 
 
 
341 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  30.58 
 
 
341 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  30.03 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  29.46 
 
 
325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  31.1 
 
 
341 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  35.81 
 
 
336 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  28.84 
 
 
317 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  30.58 
 
 
682 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  30.58 
 
 
682 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  31.6 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  28.85 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  26.95 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  26.21 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  29.17 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  30.77 
 
 
341 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  32.25 
 
 
354 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  30.58 
 
 
341 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  30.77 
 
 
341 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  30.49 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  32.02 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  29.17 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  30.28 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  27.88 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  30.49 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  30.49 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  30.49 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  28.39 
 
 
315 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  29.36 
 
 
350 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  29.06 
 
 
332 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  31.52 
 
 
351 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  30.77 
 
 
341 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  31.21 
 
 
374 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  29.01 
 
 
350 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  28.39 
 
 
318 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  31.4 
 
 
322 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  32.38 
 
 
360 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  31.33 
 
 
347 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  31.33 
 
 
347 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  29 
 
 
343 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  30.1 
 
 
365 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  28.62 
 
 
355 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  29.39 
 
 
339 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  27.27 
 
 
317 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  29.97 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  25 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  29.02 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  25.49 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  29.97 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>