270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0674 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0674  adenosine deaminase  100 
 
 
343 aa  674    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0226748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  71.89 
 
 
357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  64.79 
 
 
342 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  63.96 
 
 
398 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  64.81 
 
 
349 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  61.7 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  62.95 
 
 
349 aa  391  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3173  adenosine deaminase  61.45 
 
 
378 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  62.24 
 
 
358 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  60.42 
 
 
384 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  61.4 
 
 
342 aa  374  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0605  adenosine deaminase  59.59 
 
 
340 aa  358  8e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.624245  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24030  adenosine deaminase  57.91 
 
 
343 aa  354  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0572  adenosine deaminase  57.57 
 
 
355 aa  345  7e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00357349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4085  adenosine deaminase  47.89 
 
 
330 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  45.27 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  41.92 
 
 
325 aa  225  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  41.12 
 
 
333 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  35.2 
 
 
327 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3645  adenosine deaminase  37.28 
 
 
336 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  33.64 
 
 
327 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  33.64 
 
 
327 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  33.83 
 
 
349 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  27.98 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  33.23 
 
 
347 aa  153  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  33.23 
 
 
347 aa  153  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  27.11 
 
 
326 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  33.44 
 
 
325 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  34.12 
 
 
341 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  34.12 
 
 
341 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  32.43 
 
 
351 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  30.47 
 
 
354 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  34.12 
 
 
341 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  34.12 
 
 
341 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  33.33 
 
 
345 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  33.33 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  32.43 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  32.84 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  33.33 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  33.33 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  30.22 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  34.77 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  34.9 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  31.89 
 
 
322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  32.72 
 
 
341 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  33.33 
 
 
341 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  32.84 
 
 
350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  35.8 
 
 
368 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  33.04 
 
 
341 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  33.33 
 
 
345 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  31.67 
 
 
374 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  33.83 
 
 
342 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  33.74 
 
 
343 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  32.94 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  32.66 
 
 
366 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  31.93 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  30.46 
 
 
322 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  31.95 
 
 
359 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  35.44 
 
 
334 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  28.53 
 
 
335 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  32.63 
 
 
338 aa  139  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  31.02 
 
 
332 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  32.08 
 
 
341 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  32.94 
 
 
337 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  35.87 
 
 
332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  32.28 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  32.11 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  31.31 
 
 
353 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  34.35 
 
 
328 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  31.55 
 
 
346 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  29.36 
 
 
335 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  34.8 
 
 
340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  29.52 
 
 
346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  27.36 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  32.61 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  31.33 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  30.63 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  31.6 
 
 
378 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  30.06 
 
 
349 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  30.54 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  35.14 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  33.14 
 
 
360 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  30.95 
 
 
366 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  28.4 
 
 
361 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  28.61 
 
 
335 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  30.63 
 
 
315 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  30.49 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  30.61 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  29.38 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  34.31 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0534  adenosine deaminase  36.71 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.125477 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  29.22 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  30.03 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  30.54 
 
 
341 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  30.54 
 
 
682 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  31.65 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  30.54 
 
 
682 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  32.13 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  32.98 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  32.28 
 
 
350 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>