276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0572 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0572  adenosine deaminase  100 
 
 
355 aa  703    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00357349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3173  adenosine deaminase  72.11 
 
 
378 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  70.75 
 
 
384 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  68.84 
 
 
342 aa  435  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0605  adenosine deaminase  66.77 
 
 
340 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.624245  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  66.97 
 
 
349 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24030  adenosine deaminase  63.08 
 
 
343 aa  403  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  64.6 
 
 
358 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  57.86 
 
 
398 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0674  adenosine deaminase  57.57 
 
 
343 aa  358  6e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0226748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  59.17 
 
 
357 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  58.16 
 
 
350 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  56.08 
 
 
349 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  54.6 
 
 
342 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  44.25 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4085  adenosine deaminase  45.24 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  42.48 
 
 
325 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  41.12 
 
 
333 aa  212  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  32.63 
 
 
327 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  33.84 
 
 
331 aa  152  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  31.42 
 
 
327 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  31.42 
 
 
327 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  26.81 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3645  adenosine deaminase  35.48 
 
 
336 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  30.51 
 
 
325 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  29.97 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  29.97 
 
 
322 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  26.2 
 
 
326 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  33.33 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  33.33 
 
 
340 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  30.28 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  28.95 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  30.84 
 
 
325 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  30.61 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  31.3 
 
 
374 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  26.92 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  29.63 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  32.74 
 
 
342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  35.82 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  31.23 
 
 
348 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  28.36 
 
 
351 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  30.79 
 
 
322 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  31.58 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  29.71 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  29.88 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  28.07 
 
 
354 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  25.75 
 
 
337 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  29.19 
 
 
353 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  28.49 
 
 
346 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  29.36 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  30.86 
 
 
337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  30.03 
 
 
345 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  33.14 
 
 
366 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  25.6 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  29.73 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  27.66 
 
 
338 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  29.5 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  30.26 
 
 
378 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  27.89 
 
 
349 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  31.34 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  27.74 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  30.5 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  29.46 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  28.91 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  30.12 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  28.44 
 
 
376 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  28.57 
 
 
355 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  25.38 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  29.25 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  26.16 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  28.66 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  26.35 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  28.13 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  30.11 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  29.09 
 
 
315 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  29.87 
 
 
353 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  28.15 
 
 
341 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  29.5 
 
 
341 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  29.5 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  27.86 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  29.5 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  26.28 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  29.5 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  27.47 
 
 
315 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  27.68 
 
 
341 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  28.13 
 
 
376 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  27.98 
 
 
341 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  28.91 
 
 
341 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  28.53 
 
 
318 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  28.91 
 
 
341 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  28.91 
 
 
341 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  28.91 
 
 
341 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  27.27 
 
 
331 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  26.48 
 
 
315 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  26.44 
 
 
336 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  26.51 
 
 
347 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  28.22 
 
 
315 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  26.51 
 
 
347 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  28.15 
 
 
341 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  28.15 
 
 
682 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>