157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0697 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0697  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  100 
 
 
343 aa  698    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1604  D-cysteine desulfhydrase  38.91 
 
 
340 aa  202  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.033923  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1828  D-cysteine desulfhydrase  37.08 
 
 
340 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  37.35 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  35.65 
 
 
330 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  36 
 
 
332 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  35.14 
 
 
328 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  35.14 
 
 
328 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  36.28 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  35.14 
 
 
328 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  35.14 
 
 
328 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  35.14 
 
 
328 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  35.67 
 
 
342 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  35.67 
 
 
328 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  36.97 
 
 
337 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  36.36 
 
 
337 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28382  predicted protein  37.08 
 
 
365 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  36.23 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  36.23 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  36.23 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  36.23 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  36.23 
 
 
328 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  36.45 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  35.45 
 
 
330 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4819  D-cysteine desulfhydrase  35 
 
 
322 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  35.15 
 
 
339 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6869  D-cysteine desulfhydrase  33.73 
 
 
359 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  35.15 
 
 
339 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  36.28 
 
 
361 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  35.89 
 
 
332 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  36 
 
 
332 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  35.05 
 
 
334 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3150  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.83 
 
 
338 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.768624  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  35.37 
 
 
333 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  35.05 
 
 
334 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  35.56 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3500  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.5 
 
 
338 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2828  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.54 
 
 
335 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  normal  0.0222405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3877  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.53 
 
 
356 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.81785 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1185  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  32.83 
 
 
332 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0389534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1439  D-cysteine desulfhydrase  32 
 
 
347 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457826  normal  0.632152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0310  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  31.17 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.5 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0709789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3828  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.94 
 
 
342 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.961032  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3598  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.93 
 
 
338 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.73002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3623  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.21 
 
 
338 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05576  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.85 
 
 
338 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5155  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.73 
 
 
338 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331859  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5215  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.92 
 
 
338 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2860  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.62 
 
 
338 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0941  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.76 
 
 
335 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1521  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.99 
 
 
336 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  34.48 
 
 
338 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  33.73 
 
 
336 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3308  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.02 
 
 
338 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.0253505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0271  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.42 
 
 
337 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1212  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.63 
 
 
338 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0968144  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  35.49 
 
 
340 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4142  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.73 
 
 
338 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.77171  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1801  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.33 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5397  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.44 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0993744  normal  0.0379152 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3094  D-cysteine desulfhydrase  36.39 
 
 
339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5405  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.03 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.828504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4794  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.43 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3374  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.43 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4493  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.33 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.117981 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3006  D-cysteine desulfhydrase  36.39 
 
 
339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3059  D-cysteine desulfhydrase  36.39 
 
 
339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4836  D-cysteine desulfhydrase  33.44 
 
 
322 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2137  D-cysteine desulfhydrase  36.39 
 
 
339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  34.83 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0774  D-cysteine desulfhydrase  36.39 
 
 
339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2607  D-cysteine desulfhydrase  36.39 
 
 
339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2006  D-cysteine desulfhydrase  36.39 
 
 
339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277685  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0344  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.24 
 
 
338 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5532  D-cysteine desulfhydrase  33.63 
 
 
343 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.1518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5099  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.33 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1697  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.03 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2004  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.03 
 
 
338 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.876567  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1101  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.64 
 
 
338 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2357  D-cysteine desulfhydrase  34.04 
 
 
335 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  31.83 
 
 
331 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3675  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.13 
 
 
338 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  32.13 
 
 
331 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2636  D-cysteine desulfhydrase  34.35 
 
 
335 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  32.13 
 
 
331 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5856  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.04 
 
 
337 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0688511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  31.83 
 
 
331 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  32.13 
 
 
331 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7821  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.14 
 
 
338 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  32.13 
 
 
331 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  32.13 
 
 
331 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0934  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  32.26 
 
 
338 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  32.13 
 
 
331 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0952  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.94 
 
 
338 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114665  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0426  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.94 
 
 
338 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0218  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.94 
 
 
338 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.717443  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1880  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.94 
 
 
338 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1795  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.94 
 
 
338 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.478026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1385  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.94 
 
 
338 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0995718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>