126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0009 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0009  cytidine deaminase  100 
 
 
126 aa  254  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.080456  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5437  hypothetical protein  60.82 
 
 
100 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491914  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl466  cytidine deaminase  33.6 
 
 
134 aa  100  6e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.063527  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0733  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.85 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00269425 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0498  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.85 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.115067 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1137  cytidine deaminase  33.85 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000157258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  40.54 
 
 
131 aa  62  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  32.54 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  32.54 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  29.46 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  33.33 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  32 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  32 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  31.01 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  30.61 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  30.61 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  32.35 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  32 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  35.43 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  34.62 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4191  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  35.64 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  31 
 
 
139 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  34.78 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  32.54 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  25.98 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  30.77 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  30.77 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  30.77 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  30.77 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  30.77 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  30.77 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  32 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  29.73 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  34.31 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  30.77 
 
 
132 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  31.37 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  30.77 
 
 
132 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  36.17 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  33.06 
 
 
234 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  31.01 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  33 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  30.77 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  29 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  26.73 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4804  hypothetical protein  37.27 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558671  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  28.07 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  28.16 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  38.24 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  30.95 
 
 
388 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  37.5 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  38.95 
 
 
199 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  32 
 
 
234 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  34.65 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  38.57 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  36.84 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  30 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  32.32 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  28.33 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  33.33 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  32.99 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  30.77 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.78 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  33.33 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4270  hypothetical protein  38.18 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.372249  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  35.79 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  35.42 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2943  cytidine deaminase  38.16 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000924074 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  28.43 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  30.69 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  29.25 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  36.63 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  31 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4168  hypothetical protein  36.94 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250781  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  35.71 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  36.11 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  34.29 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  34.29 
 
 
138 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0968  cytidine deaminase  33.33 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  28 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  32.99 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  35.29 
 
 
158 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  28.43 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  36.11 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  27.55 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  36.11 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  36.11 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  36.11 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  36.11 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0684  cytidine deaminase  33.71 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  39.73 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  31.03 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2390  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.34 
 
 
249 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  27.42 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  36.11 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  36.11 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  35.05 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6907  hypothetical protein  35.45 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  27.45 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  28.7 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>