1074 genes were found for organism Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 11    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcen_5482  CDS  NC_008062  148  606  459  (2Fe-2S)-binding  YP_625327  normal  0.246902  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5483  CDS  NC_008062  628  3120  2493  twin-arginine translocation pathway signal  YP_625328  normal  0.458252  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5484  CDS  NC_008062  3221  4288  1068  AraC family transcriptional regulator  YP_625329  normal  0.221465  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5485  CDS  NC_008062  4597  5844  1248  carboxymethylenebutenolidase  YP_625330  normal  0.463594  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5486  CDS  NC_008062  5885  6673  789  short chain dehydrogenase  YP_625331  normal  0.398056  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5487  CDS  NC_008062  6738  7976  1239  hypothetical protein  YP_625332  normal  0.544992  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5488  CDS  NC_008062  7982  8509  528  flavin reductase-like, FMN-binding  YP_625333  normal  0.968149  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5489  CDS  NC_008062  8546  9502  957  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  YP_625334  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5490  CDS  NC_008062  9782  10756  975  type II secretion system protein  YP_625335  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5491  CDS  NC_008062  10793  11770  978  type II secretion system protein  YP_625336  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5492  CDS  NC_008062  11804  13168  1365  type II secretion system protein E  YP_625337  normal  0.0157969  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5493  CDS  NC_008062  13187  14395  1209  response regulator receiver protein  YP_625338  decreased coverage  0.00416697  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5494  CDS  NC_008062  14418  14861  444  TadE-like  YP_625339  hitchhiker  0.0094498  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5495  CDS  NC_008062  14858  15391  534  TadE-like  YP_625340  normal  0.0437869  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5496  CDS  NC_008062  15405  16676  1272  hypothetical protein  YP_625341  normal  0.117089  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5497  CDS  NC_008062  16702  17022  321  hypothetical protein  YP_625342  normal  0.0322935  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5498  CDS  NC_008062  17019  18947  1929  type II and III secretion system protein  YP_625343  normal  0.0729153  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5499  CDS  NC_008062  19052  19891  840  Flp pilus assembly CpaB  YP_625344  normal  0.0386531  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5500  CDS  NC_008062  19927  21327  1401  ATPase  YP_625345  normal  0.146372  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5501  CDS  NC_008062  21371  21910  540  peptidase A24A, prepilin type IV  YP_625346  normal  0.324507  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5502  CDS  NC_008062  21939  22145  207  Flp/Fap pilin component  YP_625347  normal  0.253434  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5503  CDS  NC_008062  22228  22419  192  Flp/Fap pilin component  YP_625348  normal  0.34986  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5504  CDS  NC_008062  22559  22750  192  Flp/Fap pilin component  YP_625349  normal  0.458126  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5505  CDS  NC_008062  23256  23702  447  hypothetical protein  YP_625350  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5506  CDS  NC_008062  23800  25038  1239  hypothetical protein  YP_625351  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5507  CDS  NC_008062  25035  26414  1380  hypothetical protein  YP_625352  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5508  CDS  NC_008062  26439  27482  1044  glycosyl transferase family protein  YP_625353  normal  0.465095  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5509  CDS  NC_008062  27495  27878  384  GtrA-like protein  YP_625354  normal  0.21694  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5510  CDS  NC_008062  28174  28677  504  hypothetical protein  YP_625355  normal  0.311997  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5511  CDS  NC_008062  28743  29282  540  hypothetical protein  YP_625356  normal  0.588326  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5512  CDS  NC_008062  29355  30296  942  extracellular solute-binding protein  YP_625357  normal  0.913196  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5513  CDS  NC_008062  30383  31504  1122  hypothetical protein  YP_625358  normal  0.429741  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5514  CDS  NC_008062  31899  33350  1452  major facilitator transporter  YP_625359  normal  0.514216  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5515  CDS  NC_008062  33403  34671  1269  phosphoribosylglycinamide synthetase  YP_625360  normal  0.330375  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5516  CDS  NC_008062  34680  35555  876  LysR family transcriptional regulator  YP_625361  normal  0.0587498  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5517  CDS  NC_008062  35703  36647  945  hypothetical protein  YP_625362  normal  0.370432  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5518  CDS  NC_008062  36685  37896  1212  phosphoribosylglycinamide synthetase  YP_625363  normal  0.398662  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5519  CDS  NC_008062  37880  39076  1197  major facilitator transporter  YP_625364  normal  0.752642  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5520  CDS  NC_008062  39172  40062  891  LysR family transcriptional regulator  YP_625365  normal  0.579894  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5521  CDS  NC_008062  40129  40743  615  hypothetical protein  YP_625366  normal  0.678586  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5522  CDS  NC_008062  40840  41760  921  LysR family transcriptional regulator  YP_625367  normal  0.0758082  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5523  CDS  NC_008062  41944  42168  225  hypothetical protein  YP_625368  normal  0.0292109  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5524  CDS  NC_008062  42444  42647  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_625369  normal  0.337597  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5525  CDS  NC_008062  42955  44058  1104  alpha/beta hydrolase fold  YP_625370  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5526  CDS  NC_008062  44266  44895  630  TetR family transcriptional regulator  YP_625371  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5527  CDS  NC_008062  45251  46171  921  LysR family transcriptional regulator  YP_625372  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5528  CDS  NC_008062  46253  47203  951  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_625373  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5529  CDS  NC_008062  47200  47592  393  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_625374  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5530  CDS  NC_008062  47595  48053  459  MaoC-like dehydratase  YP_625375  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5531  CDS  NC_008062  48053  49273  1221  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_625376  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5532  CDS  NC_008062  49270  50106  837  shikimate 5-dehydrogenase  YP_625377  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5533  CDS  NC_008062  50284  51516  1233  major facilitator transporter  YP_625378  normal  0.748731  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5534  CDS  NC_008062  51630  52457  828  methyltransferase type 11  YP_625379  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5535  CDS  NC_008062  52744  53646  903  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  YP_625380  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5536  CDS  NC_008062  53704  55032  1329  major facilitator transporter  YP_625381  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5537  CDS  NC_008062  55428  56348  921  LysR family transcriptional regulator  YP_625382  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5538  CDS  NC_008062  56651  57754  1104  tartrate dehydrogenase  YP_625383  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5539  CDS  NC_008062  57758  59206  1449  aldehyde dehydrogenase  YP_625384  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5540  CDS  NC_008062  59486  60424  939  cysteine synthase  YP_625385  normal  0.816879  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5541  CDS  NC_008062  60471  60878  408  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  YP_625386  normal  0.633311  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5542  CDS  NC_008062  61101  61967  867  NmrA-like  YP_625387  normal  0.0956662  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5543  CDS  NC_008062  62076  63098  1023  LysR family transcriptional regulator  YP_625388  normal  0.21475  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5544  CDS  NC_008062  63160  64212  1053  transposase, IS605 OrfB  YP_625389  normal  0.518221  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5545  CDS  NC_008062  64282  65244  963  AraC family transcriptional regulator  YP_625390  normal  0.7737  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5546  CDS  NC_008062  65397  66320  924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_625391  normal  0.958738  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5547  CDS  NC_008062  66488  67228  741  GntR family transcriptional regulator  YP_625392  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5548  CDS  NC_008062  67225  68607  1383  aminotransferase  YP_625393  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5549  CDS  NC_008062  68618  69952  1335  glutamate--ammonia ligase  YP_625394  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5550  CDS  NC_008062  70034  70381  348  hypothetical protein  YP_625395  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5551  CDS  NC_008062  70453  71217  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_625396  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5552  CDS  NC_008062  71359  72276  918  LysR family transcriptional regulator  YP_625397  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5553  CDS  NC_008062  72412  72756  345  regulatory protein, LysR  YP_625398  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5554  CDS  NC_008062  72814  73551  738  extracellular solute-binding protein  YP_625399  normal  0.340153  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5555  CDS  NC_008062  73768  74679  912  ABC transporter related  YP_625400  normal  0.356356  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5556  CDS  NC_008062  74725  75699  975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_625401  normal  0.0488095  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5557    NC_008062  75763  77635  1873      normal  0.047237  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5558  CDS  NC_008062  77632  81249  3618  allophanate hydrolase subunit 2  YP_625402  normal  0.453459  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5559  CDS  NC_008062  81338  81994  657  hypothetical protein  YP_625403  normal  0.412671  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5560  CDS  NC_008062  82006  82761  756  hypothetical protein  YP_625404  normal  0.922437  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5561  CDS  NC_008062  82961  83227  267  hypothetical protein  YP_625405  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5562  CDS  NC_008062  83647  84669  1023  ABC transport system substrate-binding protein  YP_625406  normal  0.575813  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5563  CDS  NC_008062  84817  85536  720  metallophosphoesterase  YP_625407  normal  0.387807  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5564  CDS  NC_008062  85820  86395  576  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_625408  normal  0.295471  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5565  CDS  NC_008062  86662  87186  525  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_625409  normal  0.507804  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5566  CDS  NC_008062  87289  87750  462  NUDIX hydrolase  YP_625410  normal  0.600891  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5567  CDS  NC_008062  88000  88527  528  hypothetical protein  YP_625411  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5568  CDS  NC_008062  88607  89173  567  hypothetical protein  YP_625412  normal  0.974867  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5569  CDS  NC_008062  89432  90394  963  LysR family transcriptional regulator  YP_625413  normal  0.21388  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5570  CDS  NC_008062  91209  91442  234  hypothetical protein  YP_625414  normal  0.115413  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5571    NC_008062  91581  92703  1123      normal  0.528155  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5573  CDS  NC_008062  92949  94214  1266  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  YP_625415  normal  0.95415  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5574  CDS  NC_008062  94262  96097  1836  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_625416  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5575  CDS  NC_008062  96115  97533  1419  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  YP_625417  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5576  CDS  NC_008062  97655  98110  456  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_625418  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5577  CDS  NC_008062  98368  98772  405  hypothetical protein  YP_625419  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5578  CDS  NC_008062  98943  100148  1206  sodium:dicarboxylate symporter  YP_625420  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5579  CDS  NC_008062  100165  100827  663  GntR family transcriptional regulator  YP_625421  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5580  CDS  NC_008062  100978  101442  465  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_625422  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5581  CDS  NC_008062  101488  101799  312  hypothetical protein  YP_625423  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_5582  CDS  NC_008062  102211  103377  1167  porin  YP_625424  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 11    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>