69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5557 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  95.06 
 
 		 1872 bp  2952    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  99.95 
 
 		 1872 bp  3697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5557    100 
 
 		 1873 bp  3713    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.047237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  82.05 
 
 		 1455 bp  283  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  80.4 
 
 		 1509 bp  256  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  81.6 
 
 		 1830 bp  111  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  87.5 
 
 		 1791 bp  95.6  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  89.02 
 
 		 1863 bp  91.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  81.66 
 
 		 1767 bp  89.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  94.64 
 
 		 1866 bp  87.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  96.15 
 
 		 1866 bp  87.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  94.55 
 
 		 1815 bp  85.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  84.07 
 
 		 1830 bp  81.8  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  91.53 
 
 		 1836 bp  77.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  80.11 
 
 		 1845 bp  73.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  88.06 
 
 		 1902 bp  69.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  89.83 
 
 		 1836 bp  69.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  89.83 
 
 		 1812 bp  69.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  100 
 
 		 1806 bp  67.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  90.57 
 
 		 1815 bp  65.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  88.52 
 
 		 1773 bp  65.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  84.76 
 
 		 1788 bp  65.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  86.3 
 
 		 1812 bp  65.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  95 
 
 		 1800 bp  63.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  91.67 
 
 		 1887 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  94.87 
 
 		 1404 bp  61.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  84.81 
 
 		 1383 bp  61.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  86.57 
 
 		 1857 bp  61.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  94.87 
 
 		 1404 bp  61.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  87.3 
 
 		 1572 bp  61.9  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  97.06 
 
 		 1806 bp  60  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  87.93 
 
 		 1458 bp  60  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  83.72 
 
 		 1875 bp  60  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  94.59 
 
 		 1815 bp  58  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  94.59 
 
 		 1806 bp  58  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  88.68 
 
 		 1803 bp  58  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  94.44 
 
 		 1404 bp  56  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  94.44 
 
 		 1770 bp  56  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  96.88 
 
 		 1338 bp  56  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  94.44 
 
 		 1719 bp  56  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  90.91 
 
 		 1794 bp  56  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  100 
 
 		 1794 bp  56  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  100 
 
 		 1878 bp  56  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  100 
 
 		 1806 bp  56  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  100 
 
 		 1896 bp  56  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  86.44 
 
 		 1806 bp  54  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  94.29 
 
 		 1623 bp  54  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  89.36 
 
 		 1527 bp  54  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  83.78 
 
 		 1803 bp  52  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  88 
 
 		 747 bp  52  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  90.48 
 
 		 1386 bp  52  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  92.11 
 
 		 1800 bp  52  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  94.12 
 
 		 1662 bp  52  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  94.12 
 
 		 1791 bp  52  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1550  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  96.67 
 
 		 1440 bp  52  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 1215 bp  52  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  88 
 
 		 747 bp  52  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  93.94 
 
 		 1806 bp  50.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  100 
 
 		 798 bp  50.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  96.55 
 
 		 1503 bp  50.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3641  sulfatase  100 
 
 		 1461 bp  48.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  86.54 
 
 		 1800 bp  48.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 702 bp  48.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  96.43 
 
 		 1110 bp  48.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  93.75 
 
 		 1791 bp  48.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  93.75 
 
 		 1824 bp  48.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  96.43 
 
 		 1431 bp  48.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  96.43 
 
 		 1254 bp  48.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  85.71 
 
 		 1416 bp  48.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>