13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5571 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5571    100 
 
 		 1123 bp  2226    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  99.91 
 
 		 1122 bp  2210    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  95.9 
 
 		 1122 bp  1853    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  84.38 
 
 		 1122 bp  630  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  83.92 
 
 		 1116 bp  601  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  78.35 
 
 		 1122 bp  77.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  92.31 
 
 		 3636 bp  54  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  92.31 
 
 		 921 bp  54  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  89.36 
 
 		 1128 bp  54  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  92.31 
 
 		 3633 bp  54  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 2760 bp  52  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6991  histidine kinase  92.11 
 
 		 1131 bp  52  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  88.64 
 
 		 1134 bp  48.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>