185 genes were found for organism Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Krad_4514  CDS  NC_009806  64  393  330  hypothetical protein  YP_001468097  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4515  CDS  NC_009806  742  1299  558  hypothetical protein  YP_001468098  normal  0.000616815  normal  0.61022  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4516  CDS  NC_009806  1600  1947  348  hypothetical protein  YP_001468099  hitchhiker  0.000022442  normal  0.116415  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4517  CDS  NC_009806  1971  2126  156  hypothetical protein  YP_001468100  hitchhiker  0.0000231186  normal  0.0443285  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4518  CDS  NC_009806  2239  3966  1728  hypothetical protein  YP_001468101  hitchhiker  0.00235383  normal  0.0285478  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4519  CDS  NC_009806  4086  5543  1458  hypothetical protein  YP_001468102  normal  0.151308  normal  0.0384137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4520  CDS  NC_009806  5580  5810  231  hypothetical protein  YP_001468103  normal  normal  0.0208167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4521  CDS  NC_009806  5881  6714  834  protein kinase  YP_001468104  normal  normal  0.0132404  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4522  CDS  NC_009806  6711  8108  1398  hypothetical protein  YP_001468105  normal  hitchhiker  0.00392945  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4523  CDS  NC_009806  8032  8841  810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001468106  normal  hitchhiker  0.00209537  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4524  CDS  NC_009806  9013  9897  885  hypothetical protein  YP_001468107  normal  hitchhiker  0.00201557  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4525  CDS  NC_009806  10034  10483  450  hypothetical protein  YP_001468108  normal  normal  0.012611  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4526  CDS  NC_009806  10500  11006  507  hypothetical protein  YP_001468109  normal  hitchhiker  0.00720211  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4527  CDS  NC_009806  11260  11703  444  hypothetical protein  YP_001468110  normal  hitchhiker  0.00726321  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4528  CDS  NC_009806  11779  11973  195  hypothetical protein  YP_001468111  normal  hitchhiker  0.00984673  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4529  CDS  NC_009806  12017  12919  903  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  YP_001468112  normal  hitchhiker  0.00753209  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4530  CDS  NC_009806  13224  13949  726  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_001468113  normal  hitchhiker  0.00470183  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4531  CDS  NC_009806  13946  15496  1551  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001468114  normal  hitchhiker  0.0051954  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4532  CDS  NC_009806  15665  16405  741  hypothetical protein  YP_001468115  normal  normal  0.0172248  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4533  CDS  NC_009806  16880  17446  567  hypothetical protein  YP_001468116  normal  normal  0.0109117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4534  CDS  NC_009806  17519  18268  750  hypothetical protein  YP_001468117  normal  normal  0.0182642  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4535  CDS  NC_009806  18401  18925  525  hypothetical protein  YP_001468118  normal  0.446902  normal  0.0428798  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4536  CDS  NC_009806  18964  19515  552  hypothetical protein  YP_001468119  normal  0.306141  normal  0.122693  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4537  CDS  NC_009806  19616  21496  1881  histidine kinase  YP_001468120  normal  0.0816647  normal  0.123825  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4538  CDS  NC_009806  21717  22121  405  ferric uptake regulator family protein  YP_001468121  normal  0.0148082  normal  0.344615  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4539  CDS  NC_009806  22710  25400  2691  hypothetical protein  YP_001468122  normal  0.574606  normal  0.530229  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4540  CDS  NC_009806  25645  26376  732  signal peptidase I  YP_001468123  normal  0.0613872  normal  0.498524  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4541  CDS  NC_009806  26721  28535  1815  5'-nucleotidase domain-containing protein  YP_001468124  normal  0.101042  normal  0.534355  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4542  CDS  NC_009806  28870  29205  336  regulatory protein ArsR  YP_001468125  normal  normal  0.436444  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4543  CDS  NC_009806  29217  29918  702  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  YP_001468126  normal  normal  0.488699  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4544  CDS  NC_009806  29915  30985  1071  cation diffusion facilitator family transporter  YP_001468127  normal  normal  0.586592  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4545  CDS  NC_009806  31210  31935  726  copper resistance protein CopC  YP_001468128  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4546  CDS  NC_009806  32247  32822  576  flagellar basal body-associated protein FliL  YP_001468129  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4547  CDS  NC_009806  33157  34551  1395  alkaline phosphatase  YP_001468130  normal  0.19358  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4548  CDS  NC_009806  35201  35641  441  hypothetical protein  YP_001468131  normal  0.0237363  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4549  CDS  NC_009806  35990  36589  600  hypothetical protein  YP_001468132  normal  0.6541  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4550  CDS  NC_009806  36798  37310  513  hypothetical protein  YP_001468133  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4551  CDS  NC_009806  37785  38117  333  regulatory protein ArsR  YP_001468134  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4552  CDS  NC_009806  38117  39103  987  cation efflux protein  YP_001468135  normal  0.471009  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4553  CDS  NC_009806  39228  39587  360  hypothetical protein  YP_001468136  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4554  CDS  NC_009806  40037  40897  861  NLP/P60 protein  YP_001468137  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4555  CDS  NC_009806  41046  42086  1041  hypothetical protein  YP_001468138  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4556  CDS  NC_009806  42259  42759  501  flagellar basal body-associated protein FliL  YP_001468139  normal  0.381829  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4557  CDS  NC_009806  43486  43692  207  hypothetical protein  YP_001468140  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4558  CDS  NC_009806  43696  46068  2373  transglutaminase domain-containing protein  YP_001468141  normal  0.160458  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4559  CDS  NC_009806  46409  46804  396  hypothetical protein  YP_001468142  normal  0.446301  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4560  CDS  NC_009806  47190  48899  1710  ResB family protein  YP_001468143  normal  0.601047  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4561  CDS  NC_009806  48896  50575  1680  apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001468144  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4562  CDS  NC_009806  50748  51623  876  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  YP_001468145  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4563  CDS  NC_009806  51620  52333  714  redoxin domain-containing protein  YP_001468146  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4564  CDS  NC_009806  52330  52545  216  hypothetical protein  YP_001468147  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4565  CDS  NC_009806  52549  52878  330  hypothetical protein  YP_001468148  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4566  CDS  NC_009806  52875  55094  2220  putative copper resistance protein D  YP_001468149  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4567  CDS  NC_009806  55091  55909  819  copper resistance protein CopC  YP_001468150  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4568  CDS  NC_009806  55929  56384  456  hypothetical protein  YP_001468151  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4569  CDS  NC_009806  56721  57524  804  hypothetical protein  YP_001468152  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4570  CDS  NC_009806  57597  58619  1023  cation diffusion facilitator family transporter  YP_001468153  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4571  CDS  NC_009806  58616  59122  507  regulatory protein ArsR  YP_001468154  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4572  CDS  NC_009806  59204  59917  714  DSBA oxidoreductase  YP_001468155  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4573  CDS  NC_009806  59959  60552  594  vitamin K epoxide reductase  YP_001468156  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4574  CDS  NC_009806  60909  61991  1083  cytochrome c assembly protein  YP_001468157  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4575  CDS  NC_009806  62097  62999  903  hypothetical protein  YP_001468158  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4576  CDS  NC_009806  62996  63697  702  hypothetical protein  YP_001468159  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4577  CDS  NC_009806  64331  64756  426  regulatory protein ArsR  YP_001468160  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4578  CDS  NC_009806  65237  65785  549  peptidase A8 signal peptidase II  YP_001468161  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4579  CDS  NC_009806  65932  66291  360  hypothetical protein  YP_001468162  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4580  CDS  NC_009806  66769  67509  741  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  YP_001468163  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4581  CDS  NC_009806  67485  68129  645  hypothetical protein  YP_001468164  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4582  CDS  NC_009806  68309  68458  150  hypothetical protein  YP_001468165  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4583  CDS  NC_009806  68652  68876  225  hypothetical protein  YP_001468166  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4584  CDS  NC_009806  68901  70121  1221  acyltransferase 3  YP_001468167  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4585  CDS  NC_009806  70619  70951  333  hypothetical protein  YP_001468168  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4586  CDS  NC_009806  71034  71831  798  hypothetical protein  YP_001468169  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4587  CDS  NC_009806  72265  72546  282  hypothetical protein  YP_001468170  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4588  CDS  NC_009806  72838  73059  222  heavy metal transport/detoxification protein  YP_001468171  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4589  CDS  NC_009806  73260  75863  2604  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_001468172  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4590  CDS  NC_009806  76020  76595  576  hypothetical protein  YP_001468173  normal  0.6541  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4591  CDS  NC_009806  76827  77759  933  BNR/Asp-box repeat-containing protein  YP_001468174  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4592  CDS  NC_009806  78120  78830  711  putative PGRS-family protein  YP_001468175  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4593  CDS  NC_009806  78859  79269  411  hypothetical protein  YP_001468176  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4594  CDS  NC_009806  79266  79571  306  hypothetical protein  YP_001468177  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4595  CDS  NC_009806  79708  79980  273  hypothetical protein  YP_001468178  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4596  CDS  NC_009806  79943  80254  312  hypothetical protein  YP_001468179  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4597  CDS  NC_009806  80314  80568  255  hypothetical protein  YP_001468180  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4598  CDS  NC_009806  80725  84567  3843  DNA polymerase III, alpha subunit  YP_001468181  normal  0.744008  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4599  CDS  NC_009806  84574  85107  534  hypothetical protein  YP_001468182  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4600  CDS  NC_009806  85264  85953  690  hypothetical protein  YP_001468183  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4601  CDS  NC_009806  86228  88756  2529  hypothetical protein  YP_001468184  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4602  CDS  NC_009806  88756  89862  1107  hypothetical protein  YP_001468185  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4603  CDS  NC_009806  90086  90517  432  hypothetical protein  YP_001468186  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4604  CDS  NC_009806  90601  92130  1530  monooxygenase FAD-binding  YP_001468187  normal  0.366392  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4605  CDS  NC_009806  92136  93605  1470  hypothetical protein  YP_001468188  normal  0.260183  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4606  CDS  NC_009806  93589  94263  675  hypothetical protein  YP_001468189  normal  0.605074  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4607  CDS  NC_009806  94427  95212  786  hypothetical protein  YP_001468190  normal  0.650774  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4608  CDS  NC_009806  95701  96315  615  hypothetical protein  YP_001468191  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4609  CDS  NC_009806  96308  97822  1515  hypothetical protein  YP_001468192  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4610  CDS  NC_009806  97828  98772  945  hypothetical protein  YP_001468193  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4611  CDS  NC_009806  98977  99411  435  hypothetical protein  YP_001468194  normal  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4612  CDS  NC_009806  99408  101099  1692  hypothetical protein  YP_001468195  normal  0.435048  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_4613  CDS  NC_009806  101323  101856  534  hypothetical protein  YP_001468196  normal  0.0358203  normal  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>