24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4610 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  634    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  37.6 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  37.97 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  40.07 
 
 		 283 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  32.3 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  35.14 
 
 		 281 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  33.21 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  36.26 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  33.08 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  31.56 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  34.06 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  35.15 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  29.93 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  32.38 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  32.38 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  30.34 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  31.27 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  30.8 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  22.39 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  20 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0088  hypothetical protein  20.79 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01835  hypothetical protein  21.33 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  25.4 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  25.4 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>