More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4521 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4521  protein kinase  100 
 
 
277 aa  557  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0132404 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4221  serine/threonine protein kinase  41.51 
 
 
270 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 
604 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 
594 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  26.82 
 
 
618 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0052  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
475 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
503 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 
541 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.2 
 
 
445 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1403  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
642 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.83 
 
 
594 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
598 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 
548 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
465 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
613 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  26.44 
 
 
615 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3486  serine/threonine protein kinase  29.54 
 
 
989 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00873447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0047  protein kinase  29.74 
 
 
462 aa  92.4  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576125  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 
638 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.77 
 
 
499 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.67 
 
 
1256 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
650 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.19 
 
 
675 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5794  serine/threonine protein kinase  37.75 
 
 
1309 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 
700 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
416 aa  89.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.15 
 
 
518 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
445 aa  88.6  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3676  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
501 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.779668  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  29.88 
 
 
477 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5811  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 
621 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  40.12 
 
 
694 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 
464 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 
582 aa  87  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3705  protein kinase  30.4 
 
 
449 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
497 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.8 
 
 
664 aa  86.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
641 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
757 aa  85.1  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25067  predicted protein  27.71 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.71 
 
 
652 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.36 
 
 
635 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.5 
 
 
687 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4955  protein kinase  32.52 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
723 aa  83.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3378  protein kinase  33.33 
 
 
544 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.48624  decreased coverage  0.000240313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.58 
 
 
1148 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 
1422 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3166  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
606 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  37.35 
 
 
589 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 
624 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3039  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
735 aa  82.4  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
1104 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 
763 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
450 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 
608 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  30 
 
 
620 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 
421 aa  82  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  35.33 
 
 
403 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.03 
 
 
636 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1172  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 
396 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 
513 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  26.53 
 
 
561 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.62 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7753  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.91 
 
 
613 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2697  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
691 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4435  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
542 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
628 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3485  serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 
754 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000103616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2474  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
738 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.26 
 
 
602 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  28.5 
 
 
667 aa  80.9  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
636 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
1383 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.68 
 
 
1655 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4070  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 
610 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2951  serine/threonine protein kinase-like protein  31.63 
 
 
462 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0439076  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  27.35 
 
 
621 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3956  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 
613 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0360  serine/threonine protein kinase  36.69 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8115  Serine/threonine protein kinase-like protein  35 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311057  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 
612 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  30.54 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2648  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
578 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0958386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.54 
 
 
618 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.01 
 
 
1072 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.25 
 
 
814 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  28.63 
 
 
623 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
870 aa  79.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1111  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.38 
 
 
741 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621151  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2528  Serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
376 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
451 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 
581 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  34.13 
 
 
519 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  26.27 
 
 
638 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  26.6 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>