22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4607 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  38.02 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  36.69 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  33.56 
 
 		 158 aa  72  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  34.56 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  35.19 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  35.19 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  32.23 
 
 		 149 aa  62  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  31.78 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  31.78 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  31.78 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4512  hypothetical protein  33.02 
 
 		 142 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  30.58 
 
 		 169 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  32.98 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4617  hypothetical protein  26.61 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  32.04 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  31.4 
 
 		 154 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>