23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5430 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 169 aa  342  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  40.87 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  34.39 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  37.23 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4027  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  27.97 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  31.78 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  34.97 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  29.05 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  34.34 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  33.7 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  30.58 
 
 		 261 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4512  hypothetical protein  36.15 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6444  putative transcriptional regulator, XRE family  29.75 
 
 		 380 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504715  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  31.19 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  33.03 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  33.03 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  32.33 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  27.75 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  36.49 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>