22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4134 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  38.58 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  38.58 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  37.3 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  37.3 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  37.3 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  41.12 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  35.77 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26750  hypothetical protein  30.43 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  34.55 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1054  putative transcriptional regulator, XRE family  30.61 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0488257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  32.54 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  38.36 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  33.03 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  29.41 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  31.48 
 
 		 180 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  36.11 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  32.04 
 
 		 261 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>