23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1054 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1054  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 125 aa  253  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0488257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  42.31 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  42.31 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  42.31 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  42.31 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  42.31 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  39.62 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  40.38 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  40.54 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  30.61 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  35.24 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  37.25 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26750  hypothetical protein  29.47 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  20.51 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  21.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  21.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  21.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  21.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  21.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4027  hypothetical protein  35.71 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>