30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5673 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  270  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  270  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  92.42 
 
 
132 aa  251  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  92.42 
 
 
132 aa  251  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  92.42 
 
 
132 aa  251  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  80.92 
 
 
132 aa  221  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  41.09 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  38.58 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  37.59 
 
 
154 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  40.31 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  42.64 
 
 
149 aa  88.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  41.27 
 
 
152 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1054  putative transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0488257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  35.46 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  37.88 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26750  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  35.66 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  35.19 
 
 
261 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4512  hypothetical protein  36 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  34.65 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4027  hypothetical protein  35.54 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  36.11 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0544  hypothetical protein  32.61 
 
 
179 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4617  hypothetical protein  28.8 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4212  hypothetical protein  33.86 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4702  hypothetical protein  35.4 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0112329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1399  hypothetical protein  34.67 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00112999  normal  0.0211435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  33.03 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  31.94 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>