30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13885 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  274  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  82.44 
 
 
132 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  82.44 
 
 
132 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  82.44 
 
 
132 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  80.92 
 
 
132 aa  221  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  80.92 
 
 
132 aa  221  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  41.6 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  41.12 
 
 
134 aa  90.5  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  35.38 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  41.27 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  39.53 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  39.84 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1054  putative transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0488257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  37.78 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  37.88 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  35.34 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26750  hypothetical protein  30.66 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  34.65 
 
 
261 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4027  hypothetical protein  36.59 
 
 
127 aa  60.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0544  hypothetical protein  34.78 
 
 
179 aa  58.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  35.43 
 
 
180 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  30.84 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4212  hypothetical protein  30.5 
 
 
151 aa  48.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4702  hypothetical protein  35.4 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0112329 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4512  hypothetical protein  33.03 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  31.19 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4617  hypothetical protein  24.37 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1399  hypothetical protein  31.37 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00112999  normal  0.0211435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  28.89 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>