32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3100 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  306  8e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  48.41 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  44.53 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  42.64 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  42.64 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  39.84 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  39.85 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  38.58 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  39.13 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  36.49 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  43.22 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4027  hypothetical protein  39.32 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  34.38 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  31.72 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  34.15 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4512  hypothetical protein  36.8 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26750  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1054  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0488257  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  33.03 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4212  hypothetical protein  32.8 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0544  hypothetical protein  38.21 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4617  hypothetical protein  33.71 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  36.49 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4702  hypothetical protein  30.53 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0112329 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4181  hypothetical protein  30.66 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.994158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1399  hypothetical protein  35.06 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00112999  normal  0.0211435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6444  putative transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 380 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504715  normal  0.0391985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>