23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4197 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  331  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  36.49 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  31.47 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  35.46 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  35.46 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  35.59 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  35.59 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  35.59 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  33.85 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  35.34 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  35.34 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  31.16 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  32.61 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  37.25 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  29.41 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4212  hypothetical protein  30.61 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26750  hypothetical protein  29.93 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  31.21 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  27.56 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1054  putative transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0488257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>