20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26750 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26750  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  316  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  35.14 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  31.21 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  30.43 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  30.43 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  30.43 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  30.66 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  26.76 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  30.09 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  28.47 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  29.52 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1054  putative transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0488257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  29.93 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  28.87 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  28.69 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>