28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5076 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  64.96 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  48.03 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  41.09 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  41.09 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  41.67 
 
 		 158 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  37.29 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  36.69 
 
 		 261 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  33.85 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  32.52 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  32.06 
 
 		 180 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  33.87 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4027  hypothetical protein  37.27 
 
 		 127 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  29.63 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4512  hypothetical protein  34.15 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424637  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1054  putative transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0488257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0544  hypothetical protein  29.94 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26750  hypothetical protein  30.09 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4702  hypothetical protein  34.69 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0112329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1399  hypothetical protein  36.25 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00112999  normal  0.0211435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  28.08 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  32.33 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>