31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4027 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4027  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  244  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  48.6 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  40.31 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  35.9 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  44.68 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  38.84 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  36.59 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  35.54 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  35.54 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  38.24 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  35.54 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  35.54 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  35.54 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  37.27 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  32.58 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  31.11 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  36.54 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  36.54 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  36.54 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  34.62 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  45.24 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1245  XRE family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.664422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  45.24 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  34.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1054  putative transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0488257  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 130 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>