24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0121 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  80.26 
 
 		 180 aa  240  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  40.8 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  35.17 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  36.69 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  31.2 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  31.72 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  27.97 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  62  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  28.24 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  31.16 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  30.15 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  28.36 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  35.21 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 256 aa  42  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4617  hypothetical protein  29.81 
 
 		 156 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  31.51 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4027  hypothetical protein  32.79 
 
 		 127 aa  41.2  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>