18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1040 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  327  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  40.8 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  40.44 
 
 		 180 aa  97.1  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  30.16 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  36.73 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  37.25 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  28.08 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  36.49 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  38.24 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  36.11 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  27.75 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  28.89 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  29.29 
 
 		 204 aa  41.2  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  31.94 
 
 		 132 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  31.94 
 
 		 132 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>