15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4617 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4617  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  311  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  28.8 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  28.8 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  26.15 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  25.66 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  25.6 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  25.6 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  25.6 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  26.61 
 
 		 261 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  32.19 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  24.37 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  28.68 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  33.02 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  33.71 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  25.86 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>