23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8922 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  37.29 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  37.8 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  36.21 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  34.03 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  33.83 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  31.78 
 
 		 169 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  35.19 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  35.19 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  35.19 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26750  hypothetical protein  29.52 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4027  hypothetical protein  32.58 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  33.03 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  30.84 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  29.32 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  32.98 
 
 		 261 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4617  hypothetical protein  31.78 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  27.56 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  30.34 
 
 		 159 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>