1221 genes were found for organism Burkholderia sp. 383



Page 1 of 13    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcep18194_C6524  CDS  NC_007509  537  845  309  hypothetical protein  YP_366219  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6525  CDS  NC_007509  1025  1930  906  LysR family transcriptional regulator  YP_366220  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6526  CDS  NC_007509  2070  3368  1299  adenylosuccinate synthetase  YP_366221  normal  normal  0.768523  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6527  CDS  NC_007509  3668  4609  942  LysR family transcriptional regulator  YP_366222  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6528  CDS  NC_007509  4876  5847  972  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  YP_366223  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6529  CDS  NC_007509  5860  7278  1419  peptidase M20D, amidohydrolase  YP_366224  normal  0.886662  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6530  CDS  NC_007509  7308  8561  1254  outer membrane protein, (porin)-like  YP_366225  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6531  CDS  NC_007509  8513  9904  1392  major facilitator transporter  YP_366226  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6532  CDS  NC_007509  10402  11229  828  hypothetical protein  YP_366227  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6533  CDS  NC_007509  11249  12616  1368  hypothetical protein  YP_366228  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6534  CDS  NC_007509  12906  14003  1098  hypothetical protein  YP_366229  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6535  CDS  NC_007509  14010  19049  5040  hypothetical protein  YP_366230  normal  0.826259  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6536  CDS  NC_007509  19216  19998  783  hypothetical protein  YP_366231  normal  normal  0.51441  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6537  CDS  NC_007509  19998  21377  1380  hypothetical protein  YP_366232  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6538  CDS  NC_007509  21510  22316  807  hypothetical protein  YP_366233  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6539  CDS  NC_007509  22618  23097  480  response regulator receiver domain-containing protein  YP_366234  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6540  CDS  NC_007509  23597  23938  342  XRE family transcriptional regulator  YP_366235  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6541  CDS  NC_007509  24442  24798  357  XRE family transcriptional regulator  YP_366236  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6542  CDS  NC_007509  25081  25716  636  hypothetical protein  YP_366237  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6543  CDS  NC_007509  25697  27646  1950  hypothetical protein  YP_366238  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6544  CDS  NC_007509  27657  28565  909  hypothetical protein  YP_366239  normal  normal  0.324447  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6545  CDS  NC_007509  28562  29530  969  hypothetical protein  YP_366240  normal  normal  0.329804  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6546  CDS  NC_007509  29622  29897  276  hypothetical protein  YP_366241  normal  normal  0.302538  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6547  CDS  NC_007509  30528  31769  1242  CdaR family transcriptional regulator  YP_366242  normal  normal  0.362364  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6548  CDS  NC_007509  32033  33310  1278  cytochrome c, class I  YP_366243  normal  normal  0.354799  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6549  CDS  NC_007509  33313  34932  1620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_366244  normal  normal  0.374556  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6550  CDS  NC_007509  34932  35468  537  twin-arginine translocation pathway signal  YP_366245  normal  normal  0.491999  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6551  CDS  NC_007509  35483  36490  1008  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  YP_366246  normal  normal  0.560264  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6552  CDS  NC_007509  36494  37894  1401  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  YP_366247  normal  normal  0.5987  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6553  CDS  NC_007509  38369  38683  315  hypothetical protein  YP_366248  normal  normal  0.801985  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6554  CDS  NC_007509  38697  39752  1056  multidrug resistance protein MdtN  YP_366249  normal  normal  0.89511  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6555  CDS  NC_007509  39724  41850  2127  multidrug efflux system protein MdtO  YP_366250  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6556  CDS  NC_007509  41853  43337  1485  putative outer membrane efflux protein MdtP  YP_366251  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6557  CDS  NC_007509  43337  43807  471  MarR family transcriptional regulator  YP_366252  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6558  CDS  NC_007509  44967  45872  906  LysR family transcriptional regulator  YP_366253  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6559  CDS  NC_007509  46230  47144  915  LysR family transcriptional regulator  YP_366254  normal  normal  0.882993  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6560    NC_007509  47457  47585  129      normal  normal  0.768523  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6561  CDS  NC_007509  48249  48584  336  ArsR family transcriptional regulator  YP_366255  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6562  CDS  NC_007509  48596  49102  507  protein tyrosine phosphatase  YP_366256  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6563  CDS  NC_007509  49167  50240  1074  putative arsenate-sodium symporter  YP_366257  normal  normal  0.938789  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6564  CDS  NC_007509  50262  50684  423  arsenate reductase  YP_366258  normal  normal  0.840328  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6565  CDS  NC_007509  50662  51399  738  NADPH-dependent FMN reductase  YP_366259  normal  normal  0.867301  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6566  CDS  NC_007509  51422  51850  429  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_366260  normal  normal  0.840328  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6567  CDS  NC_007509  52400  52825  426  MarR family transcriptional regulator  YP_366261  normal  normal  0.836623  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6568  CDS  NC_007509  52951  54552  1602  putative amino acid transporter  YP_366262  normal  normal  0.979574  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6569  CDS  NC_007509  54586  55848  1263  Cl- channel, voltage gated  YP_366263  normal  0.458011  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6570  CDS  NC_007509  55845  56549  705  CBS  YP_366264  normal  0.871077  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6571  CDS  NC_007509  56859  57362  504  OmpA/MotB family outer membrane protein  YP_366265  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6572  CDS  NC_007509  57767  58954  1188  major facilitator transporter  YP_366266  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6573  CDS  NC_007509  59012  60331  1320  Cl- channel, voltage gated  YP_366267  normal  0.939375  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6574  CDS  NC_007509  60495  60743  249  hypothetical protein  YP_366268  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6575  CDS  NC_007509  60768  62066  1299  manganese/iron transporter  YP_366269  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6576  CDS  NC_007509  62157  63134  978  hypothetical protein  YP_366270  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6577  CDS  NC_007509  63515  64069  555  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  YP_366271  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6578  CDS  NC_007509  64188  65156  969  esterase/lipase-like protein  YP_366272  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6579  CDS  NC_007509  65651  66238  588  hypothetical protein  YP_366273  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6580  CDS  NC_007509  66246  66773  528  hypothetical protein  YP_366274  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6581  CDS  NC_007509  66763  67992  1230  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  YP_366275  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6582  CDS  NC_007509  67989  68843  855  hypothetical protein  YP_366276  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6583  CDS  NC_007509  68840  70147  1308  FAD dependent oxidoreductase  YP_366277  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6584  CDS  NC_007509  70240  70848  609  lipocalin-like protein  YP_366278  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6585  CDS  NC_007509  70857  71957  1101  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  YP_366279  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6586  CDS  NC_007509  71954  72787  834  hypothetical protein  YP_366280  normal  0.534338  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6587  CDS  NC_007509  72920  73654  735  hypothetical protein  YP_366281  normal  0.0308609  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6588  CDS  NC_007509  73651  74262  612  sigma-24 (FecI-like)  YP_366282  normal  0.0137066  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6589  CDS  NC_007509  74567  75226  660  carbonate dehydratase  YP_366283  normal  0.022636  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6590  CDS  NC_007509  75652  78588  2937  transposase Tn3  YP_366284  normal  0.138466  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6591  CDS  NC_007509  79322  83302  3981  hemaglutinin/autotransporter like protein  YP_366285  normal  0.266295  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6592  CDS  NC_007509  83872  84555  684  two component transcriptional regulator  YP_366286  normal  0.2732  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6593  CDS  NC_007509  85335  86042  708  OmpA/MotB family outer membrane protein  YP_366287  normal  0.13573  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6594  CDS  NC_007509  86921  89185  2265  hypothetical protein  YP_366288  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6595  CDS  NC_007509  89210  91852  2643  hypothetical protein  YP_366289  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6596  CDS  NC_007509  92031  92321  291  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  YP_366290  normal  0.540075  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6597  CDS  NC_007509  92384  92767  384  nucleotide-binding protein  YP_366291  normal  0.434952  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6598  CDS  NC_007509  93189  96365  3177  hypothetical protein  YP_366292  hitchhiker  0.000923882  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6599  CDS  NC_007509  97139  98206  1068  hypothetical protein  YP_366293  decreased coverage  0.0000000567082  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6600  CDS  NC_007509  98172  98546  375  hypothetical protein  YP_366294  hitchhiker  0.00000859417  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6601  CDS  NC_007509  98552  99730  1179  hypothetical protein  YP_366295  hitchhiker  0.000967504  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6602  CDS  NC_007509  99727  100290  564  hypothetical protein  YP_366296  hitchhiker  0.00239562  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6603  CDS  NC_007509  100665  101069  405  hypothetical protein  YP_366297  hitchhiker  0.00602869  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6604  CDS  NC_007509  101352  102299  948  LysR family transcriptional regulator  YP_366298  normal  0.0610737  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6605  CDS  NC_007509  102309  103373  1065  AraC family transcriptional regulator  YP_366299  normal  0.0589608  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6606  CDS  NC_007509  103886  104770  885  LysR family transcriptional regulator  YP_366300  normal  0.015476  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6607  CDS  NC_007509  105003  106259  1257  HlyD family secretion protein  YP_366301  normal  0.032922  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6608  CDS  NC_007509  106275  109466  3192  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  YP_366302  normal  0.164679  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6609  CDS  NC_007509  109469  111001  1533  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_366303  normal  0.64888  normal  0.8754  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6610  CDS  NC_007509  111143  111856  714  carboxymethylenebutenolidase  YP_366304  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6611  CDS  NC_007509  112180  112491  312  hypothetical protein  YP_366305  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6612  CDS  NC_007509  112808  113833  1026  transcriptional regulator  YP_366306  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6613  CDS  NC_007509  113988  114629  642  metal dependent phosphohydrolase  YP_366307  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6614  CDS  NC_007509  114823  115209  387  MerR family transcriptional regulator  YP_366308  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6615  CDS  NC_007509  115297  116205  909  Alpha/beta hydrolase  YP_366309  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6616  CDS  NC_007509  116603  117073  471  hypothetical protein  YP_366310  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6617  CDS  NC_007509  117070  117549  480  hypothetical protein  YP_366311  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6618  CDS  NC_007509  117591  118529  939  Phage integrase  YP_366312  normal  normal  0.821698  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6619  CDS  NC_007509  118611  119084  474  small integral membrane protein  YP_366313  normal  normal  0.786442  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6620  CDS  NC_007509  119409  120764  1356  xanthine/uracil/vitamin C transporter  YP_366314  normal  0.685724  normal  0.577034  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6621  CDS  NC_007509  120823  121947  1125  hypothetical protein  YP_366315  normal  0.915874  normal  0.389928  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6622  CDS  NC_007509  122050  123006  957  LysR family transcriptional regulator  YP_366316  normal  0.536281  normal  0.255489  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_C6623  CDS  NC_007509  123156  125231  2076  gamma-glutamyltransferase 1  YP_366317  normal  normal  0.189852  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 13    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>