25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6579 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6579  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  373  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5848  hypothetical protein  49.71 
 
 
216 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  38.92 
 
 
171 aa  98.2  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2435  hypothetical protein  37.65 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  36.61 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  35.26 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  30.59 
 
 
171 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  34.13 
 
 
170 aa  61.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01776  hypothetical protein  35.88 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  28.57 
 
 
169 aa  58.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  30.23 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1953  hypothetical protein  30.72 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0614302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1488  hypothetical protein  32.39 
 
 
174 aa  54.7  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  33.04 
 
 
177 aa  51.6  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  26.67 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  33.58 
 
 
163 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  33.08 
 
 
193 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  34.96 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  34.15 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1115  hypothetical protein  31.06 
 
 
167 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  31.36 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  33.08 
 
 
193 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  30.33 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0955  hypothetical protein  30.12 
 
 
169 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  30.51 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>