More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6526 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
432 aa  857    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  95.6 
 
 
432 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  89.98 
 
 
432 aa  739    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  95.83 
 
 
432 aa  792    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  94.17 
 
 
429 aa  769    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  94.64 
 
 
429 aa  771    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  95.6 
 
 
453 aa  789    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  57.85 
 
 
429 aa  514  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  59.91 
 
 
430 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  58.74 
 
 
448 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  59.44 
 
 
430 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  57.67 
 
 
430 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  56.98 
 
 
430 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  56.98 
 
 
430 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  59.67 
 
 
430 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  57.21 
 
 
430 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  58.47 
 
 
432 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  58.28 
 
 
431 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  56.74 
 
 
457 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  58.74 
 
 
431 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  56.88 
 
 
430 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  56.88 
 
 
430 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  57.54 
 
 
432 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  59.44 
 
 
430 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  55.94 
 
 
430 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  59.21 
 
 
448 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  58.97 
 
 
430 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  56.05 
 
 
430 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  56.91 
 
 
429 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  55.35 
 
 
430 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  57.14 
 
 
429 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  56.67 
 
 
533 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  55.71 
 
 
430 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  60.05 
 
 
429 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  57.77 
 
 
432 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  56.38 
 
 
432 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  56.67 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  56.98 
 
 
432 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  58.31 
 
 
429 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  55.14 
 
 
430 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  56.1 
 
 
428 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  54.48 
 
 
437 aa  481  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  54.55 
 
 
431 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  55.24 
 
 
431 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  55.04 
 
 
429 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 
429 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  46.5 
 
 
431 aa  433  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  51.49 
 
 
446 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  46.95 
 
 
425 aa  425  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  50.8 
 
 
446 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  46.5 
 
 
430 aa  424  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  48.38 
 
 
442 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1825  adenylosuccinate synthetase  54.02 
 
 
448 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.260214  normal  0.42401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
432 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1070  adenylosuccinate synthetase  52.16 
 
 
446 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.763716  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  53.56 
 
 
448 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5102  adenylosuccinate synthetase  53.56 
 
 
448 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  53.56 
 
 
448 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6278  adenylosuccinate synthetase  54.02 
 
 
448 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  48.6 
 
 
430 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  53.56 
 
 
448 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  54.02 
 
 
448 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 
430 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1409  adenylosuccinate synthetase  52.87 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000087591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1226  adenylosuccinate synthetase  52.73 
 
 
446 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000419397  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 
430 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 
430 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2096  adenylosuccinate synthetase  52.28 
 
 
447 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
431 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 
431 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2076  adenylosuccinate synthetase  53.1 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  50.93 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2530  adenylosuccinate synthetase  51.95 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00750177  hitchhiker  0.00000299679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1606  adenylosuccinate synthetase  52.18 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54976  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1162  adenylosuccinate synthetase  51.71 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
436 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2178  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 
448 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2216  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 
448 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.130698  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1823  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 
448 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1333  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 
448 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.018876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  48.37 
 
 
432 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 
430 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  49.54 
 
 
435 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2344  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 
448 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  47.91 
 
 
431 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 
427 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2245  adenylosuccinate synthetase  53.1 
 
 
448 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0073  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 
448 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  44.71 
 
 
428 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  44.71 
 
 
428 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1095  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 
448 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  48.74 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  46.64 
 
 
431 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>