24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6603 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  275  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  79.85 
 
 
134 aa  227  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  53.77 
 
 
140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  40.17 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  41.88 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  41.03 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  41.03 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  41.35 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  39.13 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  41.07 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  57.58 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  42.16 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  35.4 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  36.28 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  36.89 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  35.65 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  37.14 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  34.85 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  33.91 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  49.15 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  32.32 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0078  LysE family protein  70.37 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>