132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2960 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2960  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2809  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  48.02 
 
 
210 aa  188  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  49.42 
 
 
188 aa  187  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  47.98 
 
 
193 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  47.98 
 
 
193 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  47.98 
 
 
193 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  47.98 
 
 
193 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  47.98 
 
 
193 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04011  cytochrome C oxidase assembly protein  46.67 
 
 
195 aa  185  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  47.98 
 
 
193 aa  184  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  49.14 
 
 
187 aa  184  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0123  cytochrome C oxidase assembly protein  47.95 
 
 
189 aa  184  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  50 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  47.4 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3784  cytochrome C oxidase assembly protein  46.82 
 
 
188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  47.4 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0077  cytochrome C oxidase assembly protein  48.02 
 
 
183 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  48.24 
 
 
189 aa  181  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0182  cytochrome C oxidase assembly protein  49.12 
 
 
184 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01310  cytochrome C oxidase assembly protein  48.82 
 
 
184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.782313  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  47.46 
 
 
187 aa  178  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  49.4 
 
 
189 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  44.63 
 
 
191 aa  173  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0105  cytochrome C oxidase assembly protein  49.41 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257574  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0121  cytochrome C oxidase assembly protein  49.41 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0119  cytochrome C oxidase assembly protein  49.41 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553473  normal  0.0134076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.2 
 
 
198 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0882  cytochrome C oxidase assembly protein  44.51 
 
 
182 aa  168  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0124  cytochrome C oxidase assembly protein  47.06 
 
 
188 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01000  cytochrome C oxidase assembly protein  50.32 
 
 
184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  45.35 
 
 
179 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0144  cytochrome C oxidase assembly protein  50 
 
 
182 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  43.02 
 
 
196 aa  158  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4244  cytochrome C oxidase assembly protein  41.28 
 
 
200 aa  157  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5258  cytochrome c oxidase assembly protein  42.61 
 
 
162 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  43.6 
 
 
180 aa  154  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  41.28 
 
 
203 aa  151  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1040  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.71 
 
 
175 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0038  cytochrome C oxidase assembly protein  43.33 
 
 
207 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.379373  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  40.72 
 
 
212 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  39.52 
 
 
204 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0285  cytochrome C oxidase assembly protein  42.26 
 
 
163 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  41.3 
 
 
203 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2715  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 
172 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.253936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0365  cytochrome C oxidase assembly protein  40.7 
 
 
202 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  40.8 
 
 
198 aa  141  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  39.31 
 
 
201 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0167  cytochrome C oxidase assembly protein  39.31 
 
 
201 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  39.31 
 
 
201 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  39.31 
 
 
201 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  39.31 
 
 
201 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  39.31 
 
 
201 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  40 
 
 
185 aa  140  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  42.07 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  40.56 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  38.76 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0428  cytochrome C oxidase assembly protein  39.31 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  39.52 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  38.98 
 
 
202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  39.52 
 
 
202 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  39.52 
 
 
202 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  38.8 
 
 
202 aa  137  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3821  cytochrome C oxidase assembly protein  40.46 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  39.52 
 
 
202 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  38.95 
 
 
204 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  39.52 
 
 
202 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  39.52 
 
 
202 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  38.04 
 
 
224 aa  136  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  39.52 
 
 
202 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  37.87 
 
 
182 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  38.86 
 
 
182 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  38.64 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3905  cytochrome C oxidase assembly protein  37.23 
 
 
205 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  40 
 
 
197 aa  134  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  38.33 
 
 
206 aa  134  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  38.33 
 
 
206 aa  134  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  40.59 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  37.78 
 
 
208 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1938  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.15 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233238  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1643  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.15 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0653382  normal  0.894689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  36.26 
 
 
208 aa  124  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04022  cytochrome C oxidase assembly protein  40.76 
 
 
198 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0313  cytochrome C oxidase assembly protein  35.8 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0575051 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  33.89 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  34.55 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  37.21 
 
 
219 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  34.86 
 
 
198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  35.15 
 
 
202 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  36.21 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  34.66 
 
 
206 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  36.99 
 
 
188 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  41.04 
 
 
191 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  33.9 
 
 
202 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  32.79 
 
 
205 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  40.46 
 
 
191 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  32.18 
 
 
206 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  32.95 
 
 
201 aa  101  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  38.82 
 
 
192 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  34.13 
 
 
208 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>