81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2335 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2335  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  600  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0844  ATP synthase F1, gamma subunit  34.29 
 
 
290 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2708  ATP synthase F1, gamma subunit  30.07 
 
 
275 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  26.15 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  24.37 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1071  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  25.68 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0471  ATP synthase F1, H+-transporting two-sector ATPase gamma subunit  22.68 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0106314  normal  0.135636 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0443  ATP synthase F1, gamma subunit  22.59 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0896  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  23.67 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2453  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.26 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2163  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.26 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  23.93 
 
 
282 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2328  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  19.93 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  25.22 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  22.11 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0944  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  21.4 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.58 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1274  ATP synthase F1, gamma subunit  22.26 
 
 
273 aa  53.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.145072  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0588  ATP synthase F1, gamma subunit  21.22 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.118844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1180  ATP synthase F1, gamma subunit  22.26 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.30145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  20.48 
 
 
289 aa  52.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2997  F0F1-type ATP synthase, gamma subunit  21.21 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  23.85 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  24.32 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0520  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.88 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000407991  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1169  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  18.86 
 
 
293 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.33 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.03 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  22.81 
 
 
281 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.61 
 
 
283 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1121  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  23.39 
 
 
293 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3098  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  21.54 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0775855  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.64 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.98 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  22.46 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.46 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.4 
 
 
287 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.24 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  22.18 
 
 
304 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  20.13 
 
 
288 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  24.78 
 
 
299 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  24.88 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3057  H+transporting two-sector ATPase, gamma subunit  20.28 
 
 
292 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2047  hypothetical protein  49.25 
 
 
103 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.726464  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1707  ATP synthase F1, gamma subunit  49.25 
 
 
103 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.04 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  19.26 
 
 
288 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.64 
 
 
294 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  19.33 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.38 
 
 
288 aa  45.8  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  19.93 
 
 
290 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  23.12 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1962  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  20.34 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  20 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.15 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  19.44 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  23.38 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.31 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.31 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0326  ATP synthase F1, gamma subunit  20 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  22.13 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  22.31 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  19.14 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.15 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  19.14 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  19.14 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0980  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.41 
 
 
316 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.88 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.92 
 
 
287 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.19 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.88 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.81 
 
 
286 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  27.96 
 
 
306 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  18.81 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1557  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.5 
 
 
292 aa  42.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18481  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.89 
 
 
316 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.672263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  22.05 
 
 
292 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  21.81 
 
 
286 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  18.51 
 
 
288 aa  42.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1710  ATP synthase F1, gamma subunit  24.65 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088665  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3731  ATP synthase F1, gamma subunit  22.12 
 
 
288 aa  42.4  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>